计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 800|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[建模与可视化] 有什么方法可以只对两个结构其中一个结构做镜面对称?

[复制链接 Copy URL]

45

帖子

0

威望

646

eV
积分
691

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师,我想问一下,有两个结构只对其中一个结构做镜面对称,选中其中一个结构,另一个结构也做了镜面对称,那有什么方法可以只对其中一个结构做镜面对称吗

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112492

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2023-8-4 19:05:57 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍
http://sobereva.com/610http://bbs.keinsci.com/thread-24674-1-1.html

Multiwfn里也有mirror invert的功能,可以避免用收费的GaussView
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

45

帖子

0

威望

646

eV
积分
691

Level 4 (黑子)

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-4 18:51:35 | 只看该作者 Only view this author
霍元甲 发表于 2023-8-4 11:02
请问是啥软件里的呀?

GaussView

12

帖子

0

威望

129

eV
积分
141

Level 2 能力者

9#
发表于 Post on 2023-8-4 11:02:49 | 只看该作者 Only view this author
@CHQ啦 发表于 2023-7-17 14:17
就是Edit有一个Mirror Invert,点一下就可以了

请问是啥软件里的呀?

45

帖子

0

威望

646

eV
积分
691

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-17 14:17:04 | 只看该作者 Only view this author
霍元甲 发表于 2023-7-15 15:59
你好,镜面对称是怎么做的

就是Edit有一个Mirror Invert,点一下就可以了

45

帖子

0

威望

646

eV
积分
691

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-17 08:43:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-7-16 04:11
如果这个镜面是xy、yz或xz平面的话,可以用文本编辑器打开原子坐标,把相应原子坐标的z、x或y坐标取相反 ...

哇塞,很受用,谢谢了宝

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18171

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2023-7-16 04:11:48 | 只看该作者 Only view this author
@CHQ啦 发表于 2023-6-4 04:32
请问是不是在一个文件不可以只对一个做镜面对称啊

如果这个镜面是xy、yz或xz平面的话,可以用文本编辑器打开原子坐标,把相应原子坐标的z、x或y坐标取相反数。
我最近一个工作算手性催化,我把R型过渡态做构象搜索以后批量转成S型,就是写了一个脚本按这个思路做的
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

12

帖子

0

威望

129

eV
积分
141

Level 2 能力者

5#
发表于 Post on 2023-7-15 15:59:29 | 只看该作者 Only view this author
你好,镜面对称是怎么做的

45

帖子

0

威望

646

eV
积分
691

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-4 11:32:23 | 只看该作者 Only view this author
QuantumicGuy 发表于 2023-6-3 16:27
单独拿出来,镜像后再粘到同一个文件里

请问是不是在一个文件不可以只对一个做镜面对称啊

115

帖子

0

威望

1840

eV
积分
1955

Level 5 (御坂)

#未来可寄

3#
发表于 Post on 2023-6-3 16:27:03 | 只看该作者 Only view this author
单独拿出来,镜像后再粘到同一个文件里

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112492

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-6-3 15:20:19 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “Mirror Invent ” 改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 01:22 , Processed in 0.170351 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list