计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 773|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 如何检查几何优化分子处于全局最小状态

[复制链接 Copy URL]

98

帖子

0

威望

231

eV
积分
329

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师,请问在使用Gaussian时,如何检查几何优化分子处于全局最小状态?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112492

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2023-7-20 12:57:33 | 只看该作者 Only view this author
成键方式典型的刚性分子,诸如苯,凭常识就能判断

柔性分子,需要考虑分子内弱相互作用、位阻等因素判断。拿不准就必须做构象搜索,看以下文章了解相关知识,以及怎么用molclus做构象搜索
根据Boltzmann分布计算分子不同构象所占比例
http://sobereva.com/165
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

247

帖子

1

威望

2411

eV
积分
2678

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2023-7-17 21:03:32 | 只看该作者 Only view this author
看社长的这篇博文,1. 跑动力学一段时间取一帧去分析;2. 构想搜索;3. 如果很简单的分子/构型自己把几种可能构型优化一下,比较获得的电子能量或者自由能,越低越稳定。
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html
我唯一知道的就是我一无所知,但我是化学小迷弟

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 01:31 , Processed in 0.221741 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list