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[新手求助] 基态和激发态没有使用同一个方法优化和计算频率,后续的计算结果还可以使用吗

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本帖最后由 xm.liu 于 2023-8-16 15:07 编辑

老师们好,用gaussian16优化了一系列荧光分子的基态和激发态S1,基态优化和频率计算使用的是b3lyp/6-311G(d,p),激发态优化和计算频率使用的是cam-b3lyp/6-311G(d,p),后续又使用这两个freq的计算结果计算了RMSD,重组能和HR因子及非辐射速率Kic,想请教大家这个结果可以使用吗,做这几个分子的横向比较可以吗,如果不行,现在肯定更容易的是把基态也用cam-b3lyp优化,但是这样就会造成现有的S1优化结果的起始点不再是S0,另一条路,如果重新优化激发态时间也要很久(好几个分子,结构也挺大),如果结果不能用想求助老师们有什么方法可以帮我解决这问题,十分感激

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发表于 Post on 前天 11:41 | 只看该作者 Only view this author
njtech_wk 发表于 2026-1-20 17:48
谢谢老师,我再多问一下,下面orca的关键词输入,基于基态优化的结构,来优化S1算发射,并且同时计算5个 ...

一般不要在同一个输入文件里写opt和dosoc true。那样会在带soc校正的情况下优化激发态,而且我不知道会优化第几个态,未必优化的还是S1,也可能程序直接报错。应当先用一个输入文件优化S1态,再另写一个输入文件,在收敛的S1结构下算SOC
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2026-1-20 16:04
可以,但建议用ORCA,以高斯的基态结构为初猜,重新做基态结构优化。否则发射虽然可以算,但发射结果和吸 ...

谢谢老师,我再多问一下,下面orca的关键词输入,基于基态优化的结构,来优化S1算发射,并且同时计算5个单重态和5个三重态 以及旋轨耦合耦合矩阵元 这样输入会默认优化S1的结构吗?
! OPT LibXC(B3LYP) def2-SVP def2/J def2-SVP/C RIJCOSX tightSCF noautostart miniprint
%maxcore 100000
%pal nprocs  36 end

%tddft
nroots      5         
DoSOC       true
PrintLevel  3
TPrint      1E-8
TDA         false   
triplets    true
end

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发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
njtech_wk 发表于 2026-1-19 15:37
请问一下老师 我能用Gaussian优化基态结构 然后转去ORCA做激发态的计算吗(做了发射和吸收)用Gaussian做 ...

可以,但建议用ORCA,以高斯的基态结构为初猜,重新做基态结构优化。否则发射虽然可以算,但发射结果和吸收结果不可比。
同一个软件,LibXC的泛函和非LibXC的同一个泛函结果基本可比,问题不大。如果怀疑不可比,自行从你的体系里挑一个分子,用LibXC的泛函和非LibXC的同一个泛函算单点能,看看差多少即可
Zikuan Wang
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发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 njtech_wk 于 2026-1-20 11:36 编辑
cokie 发表于 2026-1-19 21:06
没看懂你的描述,按说你只用优化好的基态几何结构是不能得到发射的,这需要优化好的激发态几何结构。
如 ...

你好 我是用Gaussian只优化了基态结构 然后用ORCA优化S1结构(模拟荧光发射,单重态和三重态各算5个 输入关键词如下所示),激发的话我就把OPT去掉,可以帮忙看一下这个输入对不对吗

!OPT LibXC(B3LYP) def2-SVP def2/J def2-SVP/C RIJCOSX tightSCF noautostart miniprint
%maxcore 100000
%pal nprocs  36 end

%tddft
nroots      5         
DoSOC       true
PrintLevel  3
TPrint      1E-8
TDA         false   
triplets    true
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发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
njtech_wk 发表于 2026-1-19 15:37
请问一下老师 我能用Gaussian优化基态结构 然后转去ORCA做激发态的计算吗(做了发射和吸收)用Gaussian做 ...

没看懂你的描述,按说你只用优化好的基态几何结构是不能得到发射的,这需要优化好的激发态几何结构。
如果你描述有误,实际指的是用Gaussian做基态、激发态的几何优化,ORCA做单点的话,那没有任何影响。ORCA有很多很好用的高精度的适合算激发态单点的方法,又快又好用。只要你确保横向做对比的几个分子用的方法一致即可。

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发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-8-16 15:43
不能,尤其是重组能、HR因子、RMSD的基态、激发态理论级别必须统一,否则就会发现即使激发过程对结构毫无影 ...

请问一下老师 我能用Gaussian优化基态结构 然后转去ORCA做激发态的计算吗(做了发射和吸收)用Gaussian做发射太慢了 基态和激发态用的都是B3LYP/def2-SVP 不过ORCA6.1.1版本里面只能用LibXC版本的B3LYP  我主要研究激发态的能级和振子强度 会不会有影响

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发表于 Post on 2023-9-25 16:01:25 | 只看该作者 Only view this author
身在盘丝洞 发表于 2023-9-24 16:13
谢谢老师指导,如果考虑这些因素去计算该如何做呢?有没有相关的博文。
另外老师无论什么溶剂我用cam-不 ...

参考https://mattermodeling.stackexch ... e-scf-a/10923#10923
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2023-9-24 23:13:12 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-9-23 19:10
会不会是低极性(或高极性)溶剂里分子的优势构象或聚集行为不同,导致发光的差异?

谢谢老师指导,如果考虑这些因素去计算该如何做呢?有没有相关的博文。
另外老师无论什么溶剂我用cam-不b3lyp都是LE,pbe1pbe都是CT这是怎么回事呢,会不会选一个在这二者之间的泛函能解决?(例如HF成分在二者之间的或者其他因素)

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发表于 Post on 2023-9-23 19:10:00 | 只看该作者 Only view this author
身在盘丝洞 发表于 2023-9-23 10:16
谢谢老师指导,我的这个只有弱相互作用,可是溶剂的影响一直体现不出来

会不会是低极性(或高极性)溶剂里分子的优势构象或聚集行为不同,导致发光的差异?
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2023-9-23 17:16:32 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-9-22 23:14
做科研不是这么个做法,如果没有彻底理解原理,导致走了弯路,更加得不偿失。
LM方程假设溶剂可以看作均 ...

谢谢老师指导,我的这个只有弱相互作用,可是溶剂的影响一直体现不出来

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发表于 Post on 2023-9-22 23:14:05 | 只看该作者 Only view this author
身在盘丝洞 发表于 2023-9-22 15:42
谢谢老师,我是做TADF的,一般都是CT或者LE,这个分子特殊了点就想着模拟看看,要是跟着推导一遍对我来讲 ...

做科研不是这么个做法,如果没有彻底理解原理,导致走了弯路,更加得不偿失。
LM方程假设溶剂可以看作均匀电介质,如果溶剂和溶质之间有比较强的相互作用(比如比较强的氢键),就会违反LM方程的基本假设,有可能就会导致偏离线性
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2023-9-22 22:42:09 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-9-22 22:21
找LM方程的原始文献,看文献是怎么推导的,逐一分析每步推导用到了什么假设,然后看这些假设你的体系是否 ...

谢谢老师,我是做TADF的,一般都是CT或者LE,这个分子特殊了点就想着模拟看看,要是跟着推导一遍对我来讲有点得不偿失,还是跟着顺一遍并不困难

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发表于 Post on 2023-9-22 22:21:54 | 只看该作者 Only view this author
身在盘丝洞 发表于 2023-9-22 15:15
老师我的数据和图片差不多,但是不了解LM方程的使用条件,搜了一下也没有太多介绍的

找LM方程的原始文献,看文献是怎么推导的,逐一分析每步推导用到了什么假设,然后看这些假设你的体系是否满足。
LM方程这种东西,我觉得还是得自己推一遍才能理解
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2023-9-22 22:15:15 | 只看该作者 Only view this author
老师我的数据和图片差不多,但是不了解LM方程的使用条件,搜了一下也没有太多介绍的

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