计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1984|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助帖,Gromacs2023.2,CUDA加速安装问题

[复制链接 Copy URL]

8

帖子

0

威望

81

eV
积分
89

Level 2 能力者

我按照sob老师的安装方法安装的Gromacs2023.2版本gpu加速版本,各种参数都正确,而且gmx -version 也显示了CUDA支持,并且驱动也安装正常,但是在提交任务的时候,并没有调用显卡进行加速,我想问一下原因是什么,感谢各位。

1.png (607.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

1.png

2.png (282.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

2.png

3.png (439.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

3.png

8

帖子

0

威望

81

eV
积分
89

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-15 23:06:50 | 只看该作者 Only view this author
Entropy.S.I 发表于 2023-9-15 19:08
首先应该做的是,保证GPU驱动兼容的最高CUDA版本>=CUDA Toolkit版本。显然,你使用了CUDA Toolkit 12.0编译 ...

谢谢您的建议,服务器显卡根本没人用,所以我才想编译一个gpu版本的gromacs,遇到这个问题。

8

帖子

0

威望

81

eV
积分
89

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-15 23:05:24 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2023-9-15 19:00
试试在命令中指定使用GPU,加上  -gpu_id 0

我尝试过了这个方法可能不行,提示
Range checking error (possible bug):Device ID 0 did not correspond to any of the 0 detected device(s)


878

帖子

17

威望

5441

eV
积分
6659

Level 6 (一方通行)

小屁孩

4#
发表于 Post on 2023-9-15 19:08:22 | 只看该作者 Only view this author
首先应该做的是,保证GPU驱动兼容的最高CUDA版本>=CUDA Toolkit版本。显然,你使用了CUDA Toolkit 12.0编译GMX,而GPU驱动是3年前的,最高只支持到CUDA 11.0

必须指出,如果有可能,请把A100 80G留给最适合它的应用,使用此GPU跑GMX过于浪费,各种意义上的浪费。
- 向着虚无前进 -

1562

帖子

0

威望

5005

eV
积分
6567

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2023-9-15 19:00:23 | 只看该作者 Only view this author
试试在命令中指定使用GPU,加上  -gpu_id 0
又菜又爱玩

95

帖子

7

威望

2659

eV
积分
2894

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2023-9-15 18:54:40 | 只看该作者 Only view this author
A100 80G,太壕了

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 11:23 , Processed in 0.167795 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list