使用VMD构建的盒子在npt模拟下盒子的真空部分能被压缩吗

ZINCxxy · 发表于 Post on 2023-10-30 15:58:11

本帖最后由 ZINCxxy 于 2023-10-30 16:12 编辑

大家好，请问使用VMD“pbc set {}”构建的盒子在npt模拟下盒子中的真空部分能被压缩吗，还是说在npt模拟的过程中，盒子大小恒定不变。感谢大家的回答

ZINCxxy · 发表于 Post on 2023-10-30 22:49:56

Frozen-Penguin 发表于 2023-10-30 16:16
NPT模拟过程中会通过调整盒子的大小使压强平衡在给定值附近

好的，明白了，谢谢

ZINCxxy · 发表于 Post on 2023-10-30 22:49:21

tsgyls 发表于 2023-10-30 20:05
npt控制的是温度和压力，所以改变的是体积，就是盒子的大小；nvt控制的是体积和温度，所以改变的是压力的大 ...

明白了，谢谢

tsgyls · 发表于 Post on 2023-10-30 20:05:36

npt控制的是温度和压力，所以改变的是体积，就是盒子的大小；nvt控制的是体积和温度，所以改变的是压力的大小

Frozen-Penguin · 发表于 Post on 2023-10-30 16:16:42

NPT模拟过程中会通过调整盒子的大小使压强平衡在给定值附近

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[VMD] 使用VMD构建的盒子在npt模拟下盒子的真空部分能被压缩吗