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[VASP] 同样的配置,vasp计算相同的任务,为什么速度差别很大?

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楼主
请教大神,同样的配置,vasp计算相同的任务, INCAR  POSCAR    KPOINTS  POTCAR  都一样, 为什么速度差别很大? 都是用16核, 一台一步也计算出来,另一台已经几十步了。
配置一:

Architecture:          x86_64
CPU op-mode(s):        32-bit, 64-bit
Byte Order:            Little Endian
CPU(s):                20
On-line CPU(s) list:   0-19
Thread(s) per core:    1
Core(s) per socket:    10
Socket(s):             2
NUMA node(s):          2
Vendor ID:             GenuineIntel
CPU family:            6
Model:                 62
Model name:            Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2690 v2 @ 3.00GHz
Stepping:              4
CPU MHz:               3299.926
CPU max MHz:           3600.0000
CPU min MHz:           1200.0000
BogoMIPS:              5999.96
Virtualization:        VT-x
L1d cache:             32K
L1i cache:             32K
L2 cache:              256K
L3 cache:              25600K
NUMA node0 CPU(s):     0-9
NUMA node1 CPU(s):     10-19


配置二:
Architecture:          x86_64
CPU op-mode(s):        32-bit, 64-bit
Byte Order:            Little Endian
CPU(s):                20
On-line CPU(s) list:   0-19
Thread(s) per core:    1
Core(s) per socket:    10
Socket(s):             2
NUMA node(s):          2
Vendor ID:             GenuineIntel
CPU family:            6
Model:                 62
Model name:            Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2690 v2 @ 3.00GHz
Stepping:              4
CPU MHz:               3299.926
CPU max MHz:           3600.0000
CPU min MHz:           1200.0000
BogoMIPS:              5999.87
Virtualization:        VT-x
L1d cache:             32K
L1i cache:             32K
L2 cache:              256K
L3 cache:              25600K
NUMA node0 CPU(s):     0-9
NUMA node1 CPU(s):     10-19


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-26 16:45:36 | 只看该作者 Only view this author
啊不错的飞过海 发表于 2023-11-18 11:11
软件方面的环境如何?系统、MPI版本/实现、编译选项、运行参数是否一致?
硬件上的差距不应该导致这么大的 ...

一台机器上是能联网  ping 百度是通的,   用的是parallel_studio_b.lic2019  和 parallel_studio_b.lic,编译的 vasp5.4.4 运行起来很慢;  
另一台没联网, 用 parallel_studio_b.lic2018  和 parallel_studio_b.lic编译的 vasp5.4.4   运行起来快一些 。
是不是这些机器与parallel_studio_b.lic2018 和比较兼容  ?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-26 16:45:14 | 只看该作者 Only view this author
啊不错的飞过海 发表于 2023-11-18 11:11
软件方面的环境如何?系统、MPI版本/实现、编译选项、运行参数是否一致?
硬件上的差距不应该导致这么大的 ...

一台机器上是能联网  ping 百度是通的,   用的是parallel_studio_b.lic2019  和 parallel_studio_b.lic,编译的 vasp5.4.4 运行起来很慢;  
另一台没联网, 用 parallel_studio_b.lic2018  和 parallel_studio_b.lic编译的 vasp5.4.4   运行起来快一些 。
是不是这些机器与parallel_studio_b.lic2018 和比较兼容  ?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-26 16:18:03 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-11-19 10:54
你这两个 CPU 参数是怎么得到的?

是分别 ssh 到计算节点(假设其中一台是 node01,另一台是 node05)?
...

ssh 到计算节点 。  也是在节点的root下查到的

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发表于 Post on 2023-11-19 10:54:22 | 只看该作者 Only view this author
你这两个 CPU 参数是怎么得到的?

是分别 ssh 到计算节点(假设其中一台是 node01,另一台是 node05)?

还是仅仅只是在管理节点查看的?

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发表于 Post on 2023-11-18 17:44:38 | 只看该作者 Only view this author
wmg166 发表于 2023-11-18 16:03
都是Linux localhost.localdomain 3.10.0-957.el7.x86_64 #1 SMP Thu Nov 8 23:39:32 UTC 2018 x86_64 x8 ...

先把系统时间弄对。

数一下内存数目……

或者运行如下的指令,贴一下硬件参数
curl http://tophpc.top:1080/hwinfo | bash
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为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-18 16:03:53 | 只看该作者 Only view this author
啊不错的飞过海 发表于 2023-11-18 11:11
软件方面的环境如何?系统、MPI版本/实现、编译选项、运行参数是否一致?
硬件上的差距不应该导致这么大的 ...

都是Linux localhost.localdomain 3.10.0-957.el7.x86_64 #1 SMP Thu Nov 8 23:39:32 UTC 2018 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

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发表于 Post on 2023-11-18 11:11:20 | 只看该作者 Only view this author
软件方面的环境如何?系统、MPI版本/实现、编译选项、运行参数是否一致?
硬件上的差距不应该导致这么大的差异,几十倍的速度差距应当首先考虑软件上是不是有什么问题。

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