求助利用gaussian进行酶簇计算的一般步骤

1009836241 · 发表于 Post on 2023-12-4 11:09:54

老师们请问一下在利用Gaussian进行酶簇模型计算时一般步骤是 1：先对起始簇模型进行优化然后进行频率计算再进行TS过渡态搜寻 IRC计算大基组单点能计算还是2：先对起始簇进行TS过渡态搜寻 IRC计算再进行大基组的单点能计算

1009836241 · 发表于 Post on 2023-12-5 22:22:59

sobereva 发表于 2023-12-5 02:34
取决于初始结构怎么获得的、合理性如何
诸如解析度很低的X光衍射得到的蛋白质结构，原子坐标可靠度很有限 ...

多谢sobereva老师的回答

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-5 02:34:31

取决于初始结构怎么获得的、合理性如何
诸如解析度很低的X光衍射得到的蛋白质结构，原子坐标可靠度很有限，找过渡态之前先优化一下结构可能很有好处

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