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[新手求助] 求助利用gaussian进行酶簇计算的一般步骤

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老师们 请问一下在利用Gaussian进行酶簇模型计算时 一般步骤是   1:先对起始簇模型进行优化然后进行频率计算 再进行TS过渡态搜寻 IRC计算 大基组单点能计算  还是2:先对起始簇进行TS过渡态搜寻 IRC计算 再进行大基组的单点能计算

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发表于 Post on 2023-12-5 02:34:31 | 只看该作者 Only view this author
取决于初始结构怎么获得的、合理性如何
诸如解析度很低的X光衍射得到的蛋白质结构,原子坐标可靠度很有限,找过渡态之前先优化一下结构可能很有好处

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-5 22:22:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-5 02:34
取决于初始结构怎么获得的、合理性如何
诸如解析度很低的X光衍射得到的蛋白质结构,原子坐标可靠度很有限 ...

多谢sobereva老师的回答

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