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[PSI4] psi4计算能量分解out文件没有sapt result

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楼主
各位老师同学大家好,最近在用Multiwfn+PSI4计算分子内相互作用能量分解,输入文件如下所示,正常结束之后输出文件没有sapt result。请问大家问题出在哪里呢?

2-sapt-C56.inp

7.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

2-sapt-C56.out

205.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2024-1-18 03:12:52 | 只看该作者 Only view this author
天天121 发表于 2024-1-15 17:33
请各位老师帮忙看一下

.err文件一开始就提示了错误原因
sobEDA.sh:行31: dos2unix: 未找到命令

显然先得把dos2unix装上再说。sobEDA的博文里也明确说了
(4)dos2unix命令必须可以正常使用。机子里没装的话就装上,比如Redhat/Rocky Linux/CentOS系统里用yum install dos2unix即可迅速安装上。


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-15 17:33:44 | 只看该作者 Only view this author
请各位老师帮忙看一下

fragment.txt

79 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

result.txt

326 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

S0-2-NBNN2.pdb

18.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

sobEDA.sh

14.48 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

sobEDA_1666447.err

1.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

sobEDA_sub.sh

328 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

system.xyz

9.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

template.gjf

101 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-15 17:30:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-1-15 15:51
你这明明是分子间能量分解而不是分子内

用sobEDAw做能量分解对计算资源、耗时的要求远远低于SAPT0,而且 ...

Sob老师您好,改为sobEDA计算但是报错了,能请您帮忙看一下吗(所有文件见楼下)

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发表于 Post on 2024-1-15 15:51:48 | 只看该作者 Only view this author
你这明明是分子间能量分解而不是分子内

用sobEDAw做能量分解对计算资源、耗时的要求远远低于SAPT0,而且精度比SAPT0更高,强烈建议改用sobEDAw
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html

SAPT0结合像样的基组对上百原子体系内存消耗巨大,内存不够大就根本别试了
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发表于 Post on 2024-1-15 10:53:13 | 只看该作者 Only view this author
天天121 发表于 2024-1-15 10:29
老师,您好,给到70GB还是没有

(1)加大内存再试;(2)检查终端上(简单说就是屏幕上)是否有显示报错,输出文件是否有报错,集群队列是否有输出报错。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-15 10:29:44 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2024-1-14 21:31
内存只给10GB太少了,大概率是由于内存不足引起的

老师,您好,给到70GB还是没有

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-14 21:58:03 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2024-1-14 21:31
内存只给10GB太少了,大概率是由于内存不足引起的

好的好的那我去试试

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发表于 Post on 2024-1-14 21:31:21 | 只看该作者 Only view this author
内存只给10GB太少了,大概率是由于内存不足引起的
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