求助：怎么用Networkview插件做蛋白残基的cross correlation图?

灵芝5

老师，您好：

我想用VMD的插件networkview做一个蛋白质的残基相关性图。我参考network_tutorial教程计算出了蛋白残基的contact.dat文件，但是不知道什么软件可以用这个文件生成下面这种残基相互作用图？




请问怎么样可以把contact.dat文件转成残基相互作用图。

rpestana94

I don't know how to use the .dat file but you can use R package bio3d which can reproduce this graph pretty easily