捐赠本论坛 (Donate this site)
开启辅助访问 切换到宽版

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 求助蛋白经过gmx pdb2gmx处理出现warning：unusual bond ...
返回列表 Return 发新帖
Views: 1565|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助蛋白经过gmx pdb2gmx处理出现warning：unusual bond between residues

[复制链接 Copy URL]
hanlu

27

帖子

0

威望

1868

eV
积分
1895

Level 5 (御坂)
跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
发表于 Post on 2024-3-21 18:29:23 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式 Reading model
320.pdb在vmd打开没waring，蛋白在经过gmxpdb2gmx处理出现warning： unusual bond betweenresidues ：27（protein）and28(none)，后与材料的gro文件组合，出现这样的warning，如下图所示

微信图片_20240321120755.png (438.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 21)

微信图片_20240321120755.png

complex_box.gro

291.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

protein.gro

22.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

320.pdb

39.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 0
回复 Reply

举报 Report

返回列表 Return 发新帖

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-26 21:15 , Processed in 0.378236 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list