捐赠本论坛 (Donate this site)
开启辅助访问 切换到宽版

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
“第9届量子化学波函数分析与Multiwfn培训班”将于12月18至22日于北京举行。这是一次性完整系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的不可错过的机会！报名将于11月27日12:00开始，预告请点击本链接查看，欢迎参加！
计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 求助蛋白经过gmx pdb2gmx处理出现warning：unusual bond ...
返回列表 Return 发新帖
Views: 659|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助蛋白经过gmx pdb2gmx处理出现warning：unusual bond between residues

[复制链接 Copy URL]
hanlu

25

帖子

0

威望

1124

eV
积分
1149

Level 4 (黑子)
跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
发表于 Post on 2024-3-21 18:29:23 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
320.pdb在vmd打开没waring，蛋白在经过gmxpdb2gmx处理出现warning： unusual bond betweenresidues ：27（protein）and28(none)，后与材料的gro文件组合，出现这样的warning，如下图所示
本主题由 sobereva 于 2024-3-21 21:06 分类

微信图片_20240321120755.png (438.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

微信图片_20240321120755.png

complex_box.gro

291.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

protein.gro

22.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

320.pdb

39.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 0
回复 Reply

举报 Report

返回列表 Return 发新帖

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 08:36 , Processed in 0.187305 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list