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[GROMACS] 使用cmake3 .. -DGMX_SIMD=AVX_512指令编译用AVX_512指令集计算的Gromacs出现错误?

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老师们好,我目前的Gromacs是用AVX2_256指令集计算的,但是我想试一下AVX_512指令集的计算速度,在使用cmake3 .. -DGMX_SIMD=AVX_512指令后,终端弹出的错误提示不是很明白,想问一下各位老师该如何解决?

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发表于 Post on 2024-5-18 23:58:05 | 只看该作者 Only view this author
12313 发表于 2024-5-18 15:52
谢谢老师,那我需要使用最新的2024版本,还是只要比2018.8新就可以了?

你去看哪个版本手册里提到了AVX_512便知
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-18 15:53:01 | 只看该作者 Only view this author
mizu-bai 发表于 2024-5-18 14:46
https://manual.gromacs.org/current/install-guide/index.html#simd-support

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-18 15:52:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-18 03:30
用gromacs更新版本

谢谢老师,那我需要使用最新的2024版本,还是只要比2018.8新就可以了?

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发表于 Post on 2024-5-18 14:46:00 | 只看该作者 Only view this author
AVX_512 Skylake-X desktop and Skylake-SP Xeon processors (2017) and AMD Zen4 (2022); on Intel it will generally be fastest on the higher-end desktop and server processors with two 512-bit fused multiply-add units (e.g. Core i9 and Xeon Gold). However, certain desktop and server models (e.g. Xeon Bronze and Silver) come with only one AVX512 FMA unit and therefore on these processors AVX2_256 is faster (compile- and runtime checks try to inform about such cases). On AMD it is beneficial to use starting with Zen4. Additionally, with GPU accelerated runs AVX2_256 can also be faster on high-end Skylake CPUs with both 512-bit FMA units enabled.


https://manual.gromacs.org/curre ... x.html#simd-support

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发表于 Post on 2024-5-18 03:30:46 | 只看该作者 Only view this author
用gromacs更新版本
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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