求问：lammps研究水溶液中的GO和有机小分子的静电吸附和π-π共轭作用力场选择？

xiao_buaa · 发表于 Post on 2024-5-23 10:42:18

各位老师好，初学lammps，存在几个问题求指导：
1.想研究水溶液中的GO和有机小分子的静电吸附和pi-pi共轭作用，请问该如何选择力场？

2.目前选用的是SPC/E水模型，但是听很多人说OPC没有特殊情况是最好的，需要换吗？

3.力场选用的是UFF（autoff建模时选择的），这个合理吗？
4.MD模拟如何反应氢键的作用呢？

谢谢各位老师！

xiao_buaa · 发表于 Post on 2024-5-24 15:36:29

xiao_buaa 发表于 2024-5-23 22:45
再想请问一下，同时采用GAFF和OPC水模型，用autiff建模的时候出现，【Warning:力场非键相互作用的1-4系数 ...

已经搞明白啦，H2O只有键、角，OPC给的1-4的参数实际上可以删掉，所以直接用GAFF给的special_bonds lj 0.0 0.0 0.5 coul 0.0 0.0 0.8333就行，谢谢！

xiao_buaa · 发表于 Post on 2024-5-23 22:45:14

牧生发表于 2024-5-23 13:12
我用gmx，给出如下建议

2.无脑就用opc水

再想请问一下，同时采用GAFF和OPC水模型，用autiff建模的时候出现，【Warning:力场非键相互作用的1-4系数 OPC:1; GAFF2:0.5 不兼容,可能产生不准确的模拟结果】，这个要如何解决呢？谢谢

xiao_buaa · 发表于 Post on 2024-5-23 15:07:03

牧生发表于 2024-5-23 13:12
我用gmx，给出如下建议

2.无脑就用opc水

感谢老师指点！！！

牧生 · 发表于 Post on 2024-5-23 13:12:10

本帖最后由牧生于 2024-5-23 13:14 编辑

我用gmx，给出如下建议

2.无脑就用opc水
3.不合理，UFF是凑合参数，远不如gaff
4.只要参数合理，自然就能反应出氢键

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[Lammps] 求问：lammps研究水溶液中的GO和有机小分子的静电吸附和π-π共轭作用力场选择？

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