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[GAMESS-US] 【求助】GAMESS编译问题

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楼主
各位老师:
你们好!

问题是这样的,我想尝试在学校的超算平台上编译GAMESS,参考的是这一个编译流程,解压 → config → compddi → compall lked 编辑rungms
http://emuch.net/html/201305/5911413.html,
学校的数学库没有mkl,但是有ACML和altas。我选了ACML
在编译到“lked”环节的时候报错了,

“collect2: ld returned 1 exit statusUnfortunately, there was an error while linking GAMESS.”

是由于没有链接到数学库导致的吗?求助,谢谢!


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发表于 Post on 2014-12-17 14:03:07 | 只看该作者 Only view this author
Tinker 发表于 2014-12-17 10:21
谢谢Sob老师,
我咨询了工作人员,他们给我了mkl的路径,按照您给的流程,编译成功了,可以在登录节点上 ...

先#PBS设置参数,然后写运行命令的部分。网上搜下很多,一般集群也会稍微改动下不是纯的tor系统需要咨询集群管理人员
本周目已沉沦,下个世界再会

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-17 10:21:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-12-16 17:28
编译方法建议参考
GAMESS-US 2013-May版编译方法
http://sobereva.com/193


谢谢Sob老师,
我咨询了工作人员,他们给我了mkl的路径,按照您给的流程,编译成功了,可以在登录节点上算个小任务。
可是接下来不太清楚PBS脚本的写法,有哪些环境变量需要export呢,rungms需要修改吗?
排队系统是Torque 2.5,


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发表于 Post on 2014-12-16 17:28:23 | 只看该作者 Only view this author
编译方法建议参考
GAMESS-US 2013-May版编译方法
http://sobereva.com/193
GAMESS-US 2011-Aug-11版编译方法
http://sobereva.com/105
GAMESS(US) 2009 R3版编译方法
http://sobereva.com/50

这只是提示是连接库的时候出错,但不一定就是数学库。

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