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[Gaussian/gview] 求助高斯报错 Symbol not recognized in MSubst.

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输出文件的最后出现了Symbol not recognized in MSubst.
在帖子里没有搜到相关的。
麻烦请教各位大佬应该怎么解决!!!非常感谢!!!

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发表于 Post on 2024-6-20 20:49:55 | 只看该作者 Only view this author
〇66 发表于 2024-6-20 18:18
谢谢老师,我记住了,以后绝对不用感叹号,不乱回帖子,我会认真阅读这些规则的。
另外想麻烦问一下,我 ...

发帖之后如果发现格式或内容有问题,点击编辑按钮重新编辑帖子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-20 18:58:38 | 只看该作者 Only view this author
wangzhe 发表于 2024-6-20 16:47
你的输入文件里有一行:
?s                -0.77750500   -2.89010700    0.22241300

好的,谢谢老师。已经解决

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-20 18:18:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-20 17:28
帖子标题不得乱用叹号,置顶的新社员必读贴以及http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html都明确说了。 ...

谢谢老师,我记住了,以后绝对不用感叹号,不乱回帖子,我会认真阅读这些规则的。
另外想麻烦问一下,我在编辑这个帖子的时候并没有那么多空行,不知道为什么发出去以后就空行那么多,应该怎么预览发帖后的效果呢。

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7#
发表于 Post on 2024-6-20 17:28:14 | 只看该作者 Only view this author
帖子标题不得乱用叹号,置顶的新社员必读贴以及http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html都明确说了。这次给你改了,下次乱用叹号直接删帖扣分处理。

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
别留出那么多空行,妨碍别人阅读。及时编辑帖子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-6-20 16:47:08 | 只看该作者 Only view this author
〇66 发表于 2024-6-20 16:17
谢谢您的答复,但是同样的坐标,我用不同的泛函计算就没有问题,这是为什么呢

你的输入文件里有一行:
?s                -0.77750500   -2.89010700    0.22241300

把这一行删掉重新计算就好了,应该是你编辑结构删除原子的时候操作不当留下的“残骸”。
Ph.D. (Hiroshima Univ.), PostDoc @Kyoto University
E-mail: wang.zhe.dr@gmail.com
Homepage: wongzit.github.io

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-20 15:17:20 | 只看该作者 Only view this author
谢谢您的答复,但是同样的坐标,我用不同的泛函计算就没有问题,这是为什么呢

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发表于 Post on 2024-6-20 11:12:14 | 只看该作者 Only view this author
错误信息已经告诉你输入文件坐标里的元素符号有问题,难道看不出来吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-20 09:45:35 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 〇66 于 2024-6-20 18:14 编辑

输入文件:


%nprocshared=64
%mem=96GB
%chk=0101ZN-R13-D-open_M062X_water_M062X_water.chk
# opt freq M062X/TZVP scrf=(SMD, solvent=water)

0101ZN-R13-D-open_M062X_water_M062X_water

0 2
C                 -4.98823900   -0.74411600   -0.07924400
C                 -3.59416000   -2.81225200   -0.11047100
C                 -2.46092400   -2.05693900   -0.01758400
C                 -2.53335700   -0.60444400   -0.02350900
C                 -3.85152300   -0.02184700    0.01021300
C                  0.42373900   -1.46369800    0.01169200
C                 -0.01989400   -0.12713600   -0.09460900
C                 -1.43678600    0.24459500   -0.03936500
C                  1.77771000   -1.73998200   -0.02822900
C                  2.30767200    0.58923900   -0.31445000
C                  0.95440700    0.87140100   -0.27177500
C                 -1.69386800    1.71850400   -0.08115000
C                 -1.40997600    2.54657100    1.00965800
C                 -1.60883000    3.91698900    0.89329300
C                 -2.08603900    4.45645200   -0.29164100
C                 -2.35816300    3.64304400   -1.38309800
C                 -2.15207300    2.27749700   -1.27281600
H                 -3.95376000    1.04942100    0.11970900
H                  0.66504600    1.90553700   -0.39534800
C                 -4.89668500   -2.17604200   -0.22769700
C                  2.73867200   -0.73129700   -0.18044200
C                 -7.31489700   -2.29214300   -0.69256600
C                 -7.23698000   -0.82828800   -1.06136600
C                 -6.34997900   -0.11407200   -0.05154200
N                  4.07439900   -1.13188400   -0.20593500
N                 -5.99025000   -2.88613100   -0.44113800
H                 -7.91542300   -2.43799900    0.20918400
H                 -7.76688600   -2.88052800   -1.49190200
H                 -6.82107700   -0.71782600   -2.06520900
H                 -8.24587800   -0.41751200   -1.06563500
H                 -6.26619800    0.95067600   -0.26479600
H                 -6.78493200   -0.22331700    0.94698400
O                 -1.28823700    0.87851400    2.69696200
C                 -0.86132900    1.99425200    2.31808800
O                 -0.02610400    2.70900600    2.92034900
H                  4.22609800   -2.13130500   -0.13345500
H                  2.12754900   -2.76511600    0.05872100
C                 -6.00401300   -4.35489500   -0.45008200
H                  3.01430400    1.38968800   -0.45453200
C                  5.20342200   -0.37165600   -0.31204800
O                  5.18434500    0.84971300   -0.37902800
C                  6.47805200   -1.18169300   -0.34948700
H                  6.46208000   -1.89154100    0.47890300
H                  6.46697000   -1.77329500   -1.27036500
C                  7.71792700   -0.30705200   -0.29903000
H                  7.73746800    0.26757700    0.63156600
H                  7.70006200    0.40479600   -1.12495500
C                  8.99975200   -1.14125100   -0.39054400
H                  8.96836000   -1.72701100   -1.31101100
N                  9.11757200   -2.04420200    0.74152000
C                 10.15204900   -0.16796400   -0.57251400
H                 10.00076600   -2.54216000    0.69202600
H                  9.14007400   -1.49984200    1.59981300
O                 10.40910200    0.37434300   -1.62492400
O                 10.84381400    0.06884100    0.54383900
H                 11.53499600    0.72649900    0.35617300
C                 -3.55532900   -4.32220500   -0.13876100
H                 -3.37640500   -4.65707400   -1.16578300
H                 -2.73192100   -4.69380900    0.46901400
C                 -4.86221200   -4.91220900    0.36340000
H                 -4.85557200   -5.99744700    0.27163100
H                 -5.00698800   -4.66111100    1.41675400
H                 -5.95398700   -4.69271700   -1.48880200
H                 -6.96906600   -4.65750300   -0.04405200
H                 -2.71990300    4.06498200   -2.31173100
H                 -1.38072700    4.55719900    1.73634700
H                 -2.34709300    1.63282100   -2.12098200
C                 -2.34146000    5.93203500   -0.37573200
F                 -3.56896900    6.26033400    0.07102500
F                 -2.26055000    6.39379600   -1.63144900
F                 -1.47245400    6.64221100    0.35836100
?s                -0.77750500   -2.89010700    0.22241300
P                 -0.84292356   -2.85772965    0.21308659
C                 -0.78197727   -4.27997583   -0.90488664
O                 -0.53430836   -3.24620365    1.65302722
C                 -0.46903132   -5.53422290   -0.39308946
C                 -1.05095754   -4.11604912   -2.26398614
C                 -0.42518401   -6.63234336   -1.24611442
H                 -0.26293044   -5.65149012    0.66381022
C                 -1.00491773   -5.21371672   -3.10925747
H                 -1.29596687   -3.13477688   -2.65679058
C                 -0.69228047   -6.47149282   -2.59893801
H                 -0.18317391   -7.61103038   -0.85184964
H                 -1.21296789   -5.09163564   -4.16452623
H                 -0.65812414   -7.32741346   -3.26137513















































































































































































































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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-20 09:44:49 | 只看该作者 Only view this author
输出文件:


Entering Gaussian System, Link 0=g16
Initial command:
/public/home/acgcwoz92l/software/g16/l1.exe "/public/home/acgcwoz92l/software/g16/scratch/Gau-64502.inp" -scrdir="/public/home/acgcwoz92l/software/g16/scratch/"
Entering Link 1 = /public/home/acgcwoz92l/software/g16/l1.exe PID=     64503.
  
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2009,2016,
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the Gaussian(R) 03 system (copyright 2003, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983,
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
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Rights clause in FAR 52.227-19.
  
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340 Quinnipiac St., Bldg. 40, Wallingford CT 06492
  
  
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computational chemistry and represents and warrants to the
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Cite this work as:
Gaussian 16, Revision A.03,
M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,
M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone,
G. A. Petersson, H. Nakatsuji, X. Li, M. Caricato, A. V. Marenich,
J. Bloino, B. G. Janesko, R. Gomperts, B. Mennucci, H. P. Hratchian,
J. V. Ortiz, A. F. Izmaylov, J. L. Sonnenberg, D. Williams-Young,
F. Ding, F. Lipparini, F. Egidi, J. Goings, B. Peng, A. Petrone,
T. Henderson, D. Ranasinghe, V. G. Zakrzewski, J. Gao, N. Rega,
G. Zheng, W. Liang, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda,
J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai,
T. Vreven, K. Throssell, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta,
F. Ogliaro, M. J. Bearpark, J. J. Heyd, E. N. Brothers, K. N. Kudin,
V. N. Staroverov, T. A. Keith, R. Kobayashi, J. Normand,
K. Raghavachari, A. P. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar,
J. Tomasi, M. Cossi, J. M. Millam, M. Klene, C. Adamo, R. Cammi,
J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, O. Farkas,
J. B. Foresman, and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2016.

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Gaussian 16:  ES64L-G16RevA.03 25-Dec-2016
                13-Jun-2024
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Will use up to   64 processors via shared memory.
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%chk=0101ZN-R13-D-open_M062X_water_M062X_water.chk
-----------------------------------------------
# opt freq M062X/TZVP scrf=(SMD, solvent=water)
-----------------------------------------------
1/18=20,19=15,26=3,38=1/1,3;
2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=19,7=101,11=2,25=1,30=1,70=32201,71=1,72=1,74=-55/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5,53=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/18=20,19=15,26=3/3(2);
2/9=110/2;
99//99;
2/9=110/2;
3/5=19,7=101,11=2,25=1,30=1,70=32205,71=1,72=1,74=-55/1,2,3;
4/5=5,16=3,69=1/1;
5/5=2,38=5,53=1/2;
7//1,2,3,16;
1/18=20,19=15,26=3/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
-----------------------------------------
0101ZN-R13-D-open_M062X_water_M062X_water
-----------------------------------------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 2
C                    -4.98824  -0.74412  -0.07924
C                    -3.59416  -2.81225  -0.11047
C                    -2.46092  -2.05694  -0.01758
C                    -2.53336  -0.60444  -0.02351
C                    -3.85152  -0.02185   0.01021
C                     0.42374  -1.4637    0.01169
C                    -0.01989  -0.12714  -0.09461
C                    -1.43679   0.2446   -0.03937
C                     1.77771  -1.73998  -0.02823
C                     2.30767   0.58924  -0.31445
C                     0.95441   0.8714   -0.27178
C                    -1.69387   1.7185   -0.08115
C                    -1.40998   2.54657   1.00966
C                    -1.60883   3.91699   0.89329
C                    -2.08604   4.45645  -0.29164
C                    -2.35816   3.64304  -1.3831
C                    -2.15207   2.2775   -1.27282
H                    -3.95376   1.04942   0.11971
H                     0.66505   1.90554  -0.39535
C                    -4.89669  -2.17604  -0.2277
C                     2.73867  -0.7313   -0.18044
C                    -7.3149   -2.29214  -0.69257
C                    -7.23698  -0.82829  -1.06137
C                    -6.34998  -0.11407  -0.05154
N                     4.0744   -1.13188  -0.20594
N                    -5.99025  -2.88613  -0.44114
H                    -7.91542  -2.438     0.20918
H                    -7.76689  -2.88053  -1.4919
H                    -6.82108  -0.71783  -2.06521
H                    -8.24588  -0.41751  -1.06564
H                    -6.2662    0.95068  -0.2648
H                    -6.78493  -0.22332   0.94698
O                    -1.28824   0.87851   2.69696
C                    -0.86133   1.99425   2.31809
O                    -0.0261    2.70901   2.92035
H                     4.2261   -2.13131  -0.13346
H                     2.12755  -2.76512   0.05872
C                    -6.00401  -4.35489  -0.45008
H                     3.0143    1.38969  -0.45453
C                     5.20342  -0.37166  -0.31205
O                     5.18435   0.84971  -0.37903
C                     6.47805  -1.18169  -0.34949
H                     6.46208  -1.89154   0.4789
H                     6.46697  -1.7733   -1.27037
C                     7.71793  -0.30705  -0.29903
H                     7.73747   0.26758   0.63157
H                     7.70006   0.4048   -1.12496
C                     8.99975  -1.14125  -0.39054
H                     8.96836  -1.72701  -1.31101
N                     9.11757  -2.0442    0.74152
C                     10.15205  -0.16796  -0.57251
H                     10.00077  -2.54216   0.69203
H                     9.14007  -1.49984   1.59981
O                     10.4091   0.37434  -1.62492
O                     10.84381   0.06884   0.54384
H                     11.535    0.7265    0.35617
C                    -3.55533  -4.32221  -0.13876
H                    -3.37641  -4.65707  -1.16578
H                    -2.73192  -4.69381   0.46901
C                    -4.86221  -4.91221   0.3634
H                    -4.85557  -5.99745   0.27163
H                    -5.00699  -4.66111   1.41675
H                    -5.95399  -4.69272  -1.4888
H                    -6.96907  -4.6575   -0.04405
H                    -2.7199    4.06498  -2.31173
H                    -1.38073   4.5572    1.73635
H                    -2.34709   1.63282  -2.12098
C                    -2.34146   5.93204  -0.37573
F                    -3.56897   6.26033   0.07103
F                    -2.26055   6.3938   -1.63145
F                    -1.47245   6.64221   0.35836
Unrecognized atomic symbol:  ?s                                                
                                                                                 
                                                                                 
                                                                                 
                                                                                 
                                                                                 
                                                                                 
                                                                                 
                                                                                 
                                                                                 
                              
Symbol not recognized in MSubst.
Error termination via Lnk1e in /public/home/acgcwoz92l/software/g16/l101.exe at Thu Jun 13 11:57:14 2024.
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