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[CP2K] 请问用CP2K计算二维体系时,设置为XY周期性,还需要在Z轴留15-20埃真空层吗?

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请问用CP2K计算二维体系时,设置为XY周期性,还需要在Z轴留15-20埃真空层吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-5 19:46:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-5 08:46
一次性用一个尽量大的,以此情况的测试为准

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2024-7-5 08:46:14 | 只看该作者 Only view this author
ljlljl 发表于 2024-7-4 15:26
谢谢老师,为了判断体系的自旋多重度,我使用了MT加XY周期性,刚开始Z轴方向盒子尺寸由Multi ...

一次性用一个尽量大的,以此情况的测试为准
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-4 15:26:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-2 21:17
先搞清楚不同Poisson solver的基本特征,北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/works ...

谢谢老师,为了判断体系的自旋多重度,我使用了MT加XY周期性,刚开始Z轴方向盒子尺寸由Multiwfn生成,计算出单重态能量更低,但是当我将Z轴方向盒子尺寸变大,算出三重态能量更低。请问这种情况下以哪种结果为准呢?

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发表于 Post on 2024-7-2 21:17:53 | 只看该作者 Only view this author
先搞清楚不同Poisson solver的基本特征,北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里讲“能量的计算及相关问题”的“低维体系的计算”部分详细讲了。诸如如果用的MT结合XY二维周期性,Z方向盒子尺寸必须大于相应方向电子密度分布跨度的至少两倍。
脱离Poisson solver和具体体系问这种问题没意义。而且还牵扯到用不用偶极校正等情况,都直接影响结果随真空区厚度的收敛速度。所有这些细节都是培训里详细讲了的,门道和细节很多,几句话说不清楚。


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-2 14:59:58 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2024-7-2 12:43
呃…… 你不就是这样做的吗……

好的,谢谢你

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发表于 Post on 2024-7-2 12:43:23 | 只看该作者 Only view this author
ljlljl 发表于 2024-7-2 11:03
那我可以直接使用XYZ周期性加足够的真空层吗?因为我发现我的体系(hBN)使用XYZ周期性加真空层计算速度 ...

呃…… 你不就是这样做的吗……

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-2 11:03:42 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2024-7-2 09:47
当然需要真空层

至于真空层的厚度到底是 10 A 还是 20 A,需要根据你自己的体系来确定。

那我可以直接使用XYZ周期性加足够的真空层吗?因为我发现我的体系(hBN)使用XYZ周期性加真空层计算速度会快很多

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发表于 Post on 2024-7-2 09:47:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 乐平 于 2024-7-2 09:49 编辑

当然需要真空层

至于真空层的厚度到底是 10 A 还是 20 A,需要根据你自己的体系来确定。
如果你是计算表面吸附分子,需要根据吸附分子的大小来确定,不是只用 10 或 20 这个数字。具体而言,是吸附之后分子的最顶部和下一周期表面的最底部之间的距离要超过 10 A 以上,而不是真空层自身的厚度。

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