计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 527|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Lammps] 求助偶极矩云图的绘制

[复制链接 Copy URL]

146

帖子

0

威望

3270

eV
积分
3416

Level 5 (御坂)

各位大佬好,求助原子偶极矩输出,用来做偶极矩云图。这个是聚偏氟乙烯(PVDF)的偶极矩的彩色云图,红蓝显示偶极矩在Z轴方向的数值大小,图片中每个原子(或者原子团)都有箭头,代表偶极矩的方向。现亟需输出原子(或者片段)偶极矩,我只会整个模型偶极矩的输出,lammps的部分in如下:
  1. variable                chunkid atom 1  
  2. compute                 DIPOLECHUNK all chunk/atom v_chunkid nchunk once ids once
  3. compute                 DIPOLE all dipole/chunk DIPOLECHUNK
  4. fix                     FILEP all ave/time 500 1 500 c_DIPOLE[*] file dipole.out mode vector
复制代码
我清楚输出每个原子偶极矩需要使用dump命令,但全局偶极矩不能用dump命令,请不吝赐教
如果有其它软件,或者我思考角度有问题,请不吝赐教



手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 16:58 , Processed in 0.147094 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list