计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 338|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[吐槽] 论 www.mdtutorials.com 的GROMACS教程历史及何谓官网教程

[复制链接 Copy URL]

251

帖子

0

威望

422

eV
积分
673

Level 4 (黑子)

A Student

本帖最后由 student0618 于 2024-9-4 14:03 编辑

Gromacs作为一个被广泛应用的程序,理所当然的有很多人都有写有关的教程。

其中一个最普及的教程是Justin A. Lemkul写的 (http://www.mdtutorials.com/gmx/index.html)。
没记错这本来是他读博时写的教程,放在他那时课题组Bevan Lab的网站。

后来2018年时旧网站要关,就修一下内容换到现在的mdtutorials.com (见https://mailman-1.sys.kth.se/pip ... 18-June/121079.html)

而Gromacs官网(https://tutorials.gromacs.org/)是叫他"other resources"的。


结论就是如Sob老师置顶贴所说,问教程有关问题最好给个网址,别说官网较好喔......


Yet to be strong in theory, yet to have enough practical skills.
Still I am having fun with MD simulation.

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-9-4 16:25:51 | 只看该作者 Only view this author
是的,这从来就不是官网教程,只是第三方用户写的,老有人说成官方教程,极其misleading。不像AMBER,GROMACS始终没有真正的官方教程。
当年我大三大四的时候,Justin在GROMACS邮件列表上非常活跃,那时候我也经常在邮件列表里发言

其实他的教程里,很多地方我都是不认同的,我也不建议初学者太当回事

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 09:43 , Processed in 1.593445 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list