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[吐槽] 论 www.mdtutorials.com 的GROMACS教程历史及何谓官网教程

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本帖最后由 student0618 于 2024-9-4 14:03 编辑

Gromacs作为一个被广泛应用的程序,理所当然的有很多人都有写有关的教程。

其中一个最普及的教程是Justin A. Lemkul写的 (http://www.mdtutorials.com/gmx/index.html)。
没记错这本来是他读博时写的教程,放在他那时课题组Bevan Lab的网站。

后来2018年时旧网站要关,就修一下内容换到现在的mdtutorials.com (见https://mailman-1.sys.kth.se/pip ... 18-June/121079.html)

而Gromacs官网(https://tutorials.gromacs.org/)是叫他"other resources"的。


结论就是如Sob老师置顶贴所说,问教程有关问题最好给个网址,别说官网较好喔......


Yet to be strong in theory, yet to have enough practical skills.
Still I am having fun with MD simulation.

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发表于 Post on 2024-9-4 16:25:51 | 只看该作者 Only view this author
是的,这从来就不是官网教程,只是第三方用户写的,老有人说成官方教程,极其misleading。不像AMBER,GROMACS始终没有真正的官方教程。
当年我大三大四的时候,Justin在GROMACS邮件列表上非常活跃,那时候我也经常在邮件列表里发言

其实他的教程里,很多地方我都是不认同的,我也不建议初学者太当回事

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