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[CASTEP/Dmol3/MS] 在Material studio中如何把DFT-D3加进去?

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投稿的时候遇到了问题,想知道在Material studio中如何把DFT-D3加进去,找了好久没找到对应的方法。作者在计算部分采用了几个有问题的做法。例如,当他们使用DFT-D校正来解释色散力时,他们应该考虑DFT-D3DFT-D4,它们提供更好的性能。

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发表于 Post on 2025-2-13 10:38:30 | 只看该作者 Only view this author
zhaoquanyou 发表于 2025-2-10 19:11
你好大神,这个我搜不到,能详细的说一下吗

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发表于 Post on 2025-2-13 10:25:33 | 只看该作者 Only view this author
zhaoquanyou 发表于 2025-2-10 19:30
我就一直道歉,然后说了一下是MS这个软件不支持D3色散校正,然后说接下来的工作会使用其他的软件对计算的 ...

对的,我现在在修改。不知道该咋弄,我初始用的是DFT_D Grimme, 我在HELP文档中没搜到D2和D3,话说有D2吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-10 19:30:26 | 只看该作者 Only view this author
yanni117164 发表于 2025-2-10 12:47
请问您是如何回复的?我也是用ms的castep计算的,审稿人问了同样的问题。能加wx请教下否?

我就一直道歉,然后说了一下是MS这个软件不支持D3色散校正,然后说接下来的工作会使用其他的软件对计算的问题进行完善,我这么说也是没办法,你也碰到这个问题了,因为当时也是确实不会其他的软件,也是从最近开始学习vasp和cp2k的,发现他们加D3(BJ)是真的很简单。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-10 19:11:26 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2025-2-10 16:05
在一个豆芽菜文字的下载站

你好大神,这个我搜不到,能详细的说一下吗

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发表于 Post on 2025-2-10 16:05:06 | 只看该作者 Only view this author
zhangbo11011 发表于 2024-12-16 10:09
MS 2024有D4色散,但是目前找不知道在哪里下这个版本

在一个豆芽菜文字的下载站
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发表于 Post on 2025-2-10 12:47:55 | 只看该作者 Only view this author
请问您是如何回复的?我也是用ms的castep计算的,审稿人问了同样的问题。能加wx请教下否?

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发表于 Post on 2024-12-16 10:09:04 | 只看该作者 Only view this author
MS 2024有D4色散,但是目前找不知道在哪里下这个版本

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-9 14:55:01 | 只看该作者 Only view this author
好的好的,我会注意发帖不规范的问题,但是CP2K感觉不太好上手,在网上找不到比较系统的课程,后续也会学习一下,感谢社长

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发表于 Post on 2024-10-9 03:48:34 | 只看该作者 Only view this author
zhaoquanyou 发表于 2024-10-8 19:21
好的,谢谢了,就是审稿人问的,, while they used the DFT-D correction to account for dispersion for ...

免费的CP2K支持DFT-D3和D4,算大体系速度远快于VASP,本论坛里流行程度已超过VASP:
2024年计算化学公社举办的计算化学程序和DFT泛函的流行程度投票结果
http://sobereva.com/706http://bbs.keinsci.com/thread-45272-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-10-9 03:47:42 | 只看该作者 Only view this author
zhaoquanyou 发表于 2024-10-8 17:40
对了,我是用Material studio的CASTEP模块算的

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
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发表于 Post on 2024-10-9 03:47:20 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “DFT-D3” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理!
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发表于 Post on 2024-10-8 19:39:21 | 只看该作者 Only view this author
zhaoquanyou 发表于 2024-10-8 19:21
好的,谢谢了,就是审稿人问的,, while they used the DFT-D correction to account for dispersion for ...

据我所知MBD应该还可以,DFT-D2和TS显然太容易被问了,尤其是审稿人对一些corner case不太清楚的情况很容易想当然问一些东西。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-8 19:21:59 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2024-10-8 19:18
MS CASTEP可能不同于独立的学术版CASTEP,老版本可能只有DFT-TS和DFT-D2,新版本多了个DFT-MBD。这样一来大 ...

好的,谢谢了,就是审稿人问的,, while they used the DFT-D correction to account for dispersion forces, they should have considered DFT-D3 or DFT-D4, which offer better performance. 也没办法去解决,以后还是学VASP吧

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发表于 Post on 2024-10-8 19:18:35 | 只看该作者 Only view this author
MS CASTEP可能不同于独立的学术版CASTEP,老版本可能只有DFT-TS和DFT-D2,新版本多了个DFT-MBD。这样一来大概有这几种方式:
1、TS、D2、MBD三种方法里面可能MBD的数据还算OK,那么你就需要先去找文献核实这个结论MBD还算过得去,然后再用DFT-MBD重新算一遍。
2、通过python ase调用MS CASTEP计算能量和力等,同时可以外挂DFT-D3或者DFT-D4等等,然后用ase的优化器进行结构优化等过程。里面存在着一些坑,比如ase调用CASTEP的接口有可能并不是MS的CASTEP,那么就得自己去写个接口。
3、去申请个学术版的CASTEP,然后编译的时候挂DFT-D3,我没有相关经验不知道会遇到什么坑。
4、DFT-D3也并非无懈可击,确实存在一些体系加了不如不加,或者还不如D2的结果,或是也许和D2的结果差异对你的体系或者类似体系可以忽略不计,这种情况可以找足够的文献作为证据支撑,但买不买账还得看审稿人。
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