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[Gaussian/gview] Gaussian 16 / GaussView 6 新功能

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本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-4-20 03:28 编辑

本文在 (1) 在文章内容开始前注明出处、作者 (2) 非商业用途 的前提下可以任意转载。
(以我感觉对我的实用性为序)

P.S. G16的第一个公开版本是Gaussian 16 A.03

Gaussian 16 新功能

  • 支持在限制性优化、柔性扫描等任务中,使用新的广义内坐标定义方式 (一门小语言,这是新Gaussian里面唯一令我眼馋的东西 →_→,非常灵活)

              通过 geom=GIC 声明一个新的输入段落编写下列内容
              可以定义几何变量名,如 HOH=A(2 , 1 , 3);对变量进行运算;运算中修改数值;使用条件控制语句;协同的限制性优化、柔性扫描

              支持的几何变量函数:
                            原来的键长、键角、二面角、线性弯曲 R、A、D、L
                            原子坐标分量 X、Y、Z
                            n个原子的重心分量 XCntr、YCntr、ZCntr (如XCntr(1 , 12 - 15 , 27) 表示这5个原子重心的原子坐标 X 分量)
                            两向量的点积 DotDiff(i , j , k , l) = ( i - j ) · ( k - l ),其中 i , j , k , l 为原子序号对应的坐标向量

              支持的数学运算:加、减、乘、除、乘方,开方 SQRT,指数 EXP,三角函数 SIN、COS、TAN,ARCCOS

              支持的操作:
                            冻结     Frozen
                            柔性扫描     StepSize=x, NSteps=n
                            (恢复)指定初值     Value=X
                            增加 / 不增加 / 删除冗余内坐标     Active / Inactive / Kill
                            输出值     PrintOnly
                            指定初始Hessian中的相应对角项数值     ForceConstant = x
                            在特定数值区间内时激活选项    Min, Max
                            条件控制语句     OnlyIf, IfNot

              使用示例:

  • 计算两分子/两分子片段间的电子能量转移速率(rate of EET),可用于考察光化学中的常见过程如 M* + A --> M + A*
  • 新方法:
              半经验:PM7
              泛函:M08系列(?)MN15MN15L
              双杂化:DSDPBEP86PBE0DHPBEQIDH
  • 更好的 GEDIIS 几何优化方法
  • 提供 opt=recalc 选项代替原来隐藏的 IOp(1/40=n) 选项,在优化过程中每隔n步计算一次精确 Hessian
  • TD-DFT 解析 Hessian (可用于激发态频率、红外拉曼、过渡态优化、IRC);(注:不支持TD+SCRF的解析频率,即只能不加溶剂做)
  • 提供高斯与 C++, Fortran, Python, Perl 的接口
  • 优化核数较多时高斯的并行效率
  • 可以指定 Gaussian 使用的 CPU 线程号(其实这个功能完全可以通过排队程序管理):
              使用 %CPU=0‑7 可以指定 Gaussian 使用第1个至第8个线程,在只有8个线程的机器上等效于 %nprocshared=8
              使用 %CPU=0-16/2 指定 Gaussian 使用第 1、3、5、7、9、11、13、15 号线程,主要用于防止挤在某核超线程出来的两个线程中、及在多 CPU 的机器上均衡负载
              P.S. Gaussian 官方推荐关掉超线程了,WTF!抽空发个评测打脸。
  • 支持在命令行或环境变量中定义原来的各 %link0 选项

  • 修改了一些默认设置
              全面提升各种默认积分精度:
                            默认积分精度从 1E-10 修改为了 1E-12,等价于默认 int=ACC2E=12
                            在所有 DFT 计算中默认 int=UltraFine (吃饱了撑的?)
                            CPHF 默认 int=SG1
              修改默认内存使用量至 %mem=800MB
              SCRF默认算法修改为“symmetric form of IEFPCM”,之前没有这个功能(竟然不是SMD)
              使用2010年公布的基本物理常数
              竟然没有改进 IRC 算法、也没有改默认 IRC 选项


GaussView 6 (都比较实用,好评)

  • 支持简单的构象搜索(感觉类似HyperChem,随机笛卡尔坐标移动、随机二面角旋转、随机环构象翻转)


  • 支持MMFF94力场(此条未列出,根据上一条发现)
  • 创建初猜结构时使用对称性工具降低(破坏)分子对称性
  • 支持对一批分子使用同一套关键词批量创建输入文件
  • 自带简单的任务排队功能
  • Summary可以显示更多实用的量

  • 同时显示多个光谱

  • 曲线似乎好看点儿了(此条也未列出,据图发现)
  • 支持通过鼠标拖动轨迹快速选择原子

  • 创建计算时有更多鼠标能点出来的选项(%oldchk,预览产生的输出文件,等)
  • 保存MP4格式动画视频
  • 显示PCM溶剂空腔
  • 显示非谐振振动光谱、ORD、振动耦合电子光谱结果

以及我觉得我用不着的 Gaussian 16 新功能:

  • GPU加速:Linux 下支持 HF 和 DFT 计算中用 Tesla K40、K80 显卡加速(支持的GPU、价格都一个顶俩CPU →_→,思路新颖)
  • 优化内存使用策略,避免(减少?)了CCSD迭代过程中读写硬盘
  • 优化活性空间>10*10的CASSCF,可以做包含16个轨道的活性空间的CASSCF
  • 大幅优化W1热力学组合方法中核相关能的计算
  • EOMCC 解析梯度 (几何优化)
  • 可在用非谐振模型计算 VCD 和 ROA 谱
  • 振动耦合电子光谱及峰强度计算

以及我不知道什么意思的 Gaussian 16 新功能:

  • Adamo excited state charge transfer diagnostic (仿佛是某种激发过程的波函数分析方法?)
  • The EOMCC solvation interaction models of Caricato
  • Gaussian 16 incorporates algorithmic improvements for significant speedup of the diagonal, second-order self-energy approximation (D2) component of composite electron propagator (CEP) methods as described in [DiazTinoco16].


应有(期待)却没有更新的功能:(参考 7L of http://bbs.keinsci.com/thread-1802-1-1.html

  • 高效率 RI 加速(看来 ORCA 还能活的很好)
  • 方法:PWPB95、CASPT2、KT 泛函、CC2、CC3、DSD-BLYP、MP2.5、SCS-MP2
  • 基组: LanL2TZ, LanL08/LanL08(d), def2-xZVPD (分明是举手之劳。。。)
  • CDFT
  • DKHSO of DFT;态-态旋轨耦合
  • 可接受的高维PBC
  • Linda 并行效率
  • 能量分解

  • (?) IOp(5/13=1) 的警告(未知,之前向Gaussian客服提出这个意见,其表示接受)
  • (?) 输出的改进
  • (?) 报错的改进


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发表于 Post on 2024-10-31 18:39:19 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian 16 A.03是win64版本不,有知道的大佬没

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发表于 Post on 2020-7-7 05:12:44 | 只看该作者 Only view this author
黄时清 发表于 2020-7-3 12:58
请问gaussview6能和gauss09联用吗?

gview6打开G09算的IRC有问题,其它的没发现显著问题
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发表于 Post on 2020-7-3 13:02:25 | 只看该作者 Only view this author
黄时清 发表于 2020-7-3 12:58
请问gaussview6能和gauss09联用吗?

部分功能不完全兼容。

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发表于 Post on 2020-7-3 12:58:37 | 只看该作者 Only view this author
请问gaussview6能和gauss09联用吗?

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发表于 Post on 2019-3-6 15:50:30 | 只看该作者 Only view this author
我做得一个计算发现这样的结果。
G16中的iop(5/13=1):
若iop(5/13=1)与scf(maxcyc=xx)一起使用,则实际SCF最大尝试步数由xx指定;
若只写iop(5/13=1)不写scf(maxcyc=xx),则SCF使用比默认数值更少的最大步数。
上述两种情况下,若SCF在最大步数达到之后未收敛,并不会按照以往该iop的功能进行下一步优化,而是直接退出,且给出一个警告:
SCF has not converged.  Gradients and post-SCF results would be GARBAGE!!
华北电力大学数理学院,理论与计算化学,团簇、表面的结构与反应机理。(招第一性原理计算,量子化学计算方向的教师、硕士/博士研究生)

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发表于 Post on 2019-1-8 16:49:03 | 只看该作者 Only view this author
之前用G09算IRC, 很顺畅 自从换了G16, 都大半个月了 一个IRC也没算出来

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发表于 Post on 2018-8-10 05:10:19 | 只看该作者 Only view this author
pengzh 发表于 2018-8-9 10:41
请问,D3BJ能不能支持算Am,Cm及以后的元素?谢谢

问题别发到无关帖子后头,注意保持论坛秩序
1~94号元素都支持,DFT-D3原文标题上就写明了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-8-9 10:41:53 | 只看该作者 Only view this author
请问,D3BJ能不能支持算Am,Cm及以后的元素?谢谢

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发表于 Post on 2017-12-21 17:38:39 | 只看该作者 Only view this author
ironman_2 发表于 2017-12-21 14:52
太NB了,膜拜膜拜啊,Gaussian16到了那个版本了?

一直都是A.03
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发表于 Post on 2017-12-21 15:08:11 | 只看该作者 Only view this author
看起来GV6增加的功能很实用,想换成它了。

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发表于 Post on 2017-12-21 14:52:02 | 只看该作者 Only view this author
太NB了,膜拜膜拜啊,Gaussian16到了那个版本了?

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发表于 Post on 2017-12-21 13:41:55 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2017-12-20 21:13:57 | 只看该作者 Only view this author
和GV5相比,GV6有点卡

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发表于 Post on 2017-12-20 21:13:53 | 只看该作者 Only view this author
锁塘柳烟池 发表于 2017-12-20 21:00
为什么我使用构象搜索功能不能提交呢,submit是灰的

构象搜索好像是要购买的。应该不是自带的。

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发表于 Post on 2017-12-20 21:00:20 | 只看该作者 Only view this author
为什么我使用构象搜索功能不能提交呢,submit是灰的

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