实验室分子动力学模拟服务器配置咨询

chengecg · 发表于 Post on 2024-11-11 16:11:20

大家好！
实验室想组装一台用于分子动力学模拟的服务器，预算在四五万的样子。下面是Sob老师的推荐（http://sobereva.com/444），想请教下还可以在哪些方面再提高下吗？谢谢！

极高性能分子动力学服务器推荐配置
CPU：AMD Ryzen 9 7950X（16核，4.5-5.7G，集显）
主板：技嘉B650M AORUS ELITE AX 小雕
CPU、主板套装价约4250
散热器：瓦尔基里GL360水冷 630元
硬盘：希捷银河企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B)  1330
显卡：微星4090D-魔龙SLIM-24G  15000（预算不够的话用微星万图师RTX 4080 SUPER 16G VENTUS 3X OC，9000）
内存：2*金士顿FURY 32GB DDR5-5200  2*650
电源：海韵FOCUS GX-1000 ATX3 1300
机箱：先马黑洞X  390
键盘鼠标：罗技MK200 多媒体套装  80
总价：约24300

chengecg · 发表于 Post on 2024-11-13 15:16:29

好的，谢谢各位老师的信息！

abin · 发表于 Post on 2024-11-12 13:11:29

我这边测试，
NAMD.GPU，在固态硬盘，跑得更快。

两台的话，每台机器，
SATA 固态做系统盘，240GB即可；
一块NVMe固态，计算读写。

两台机器，配置一个机械硬盘，做数据。

千兆或者万兆连起来， slurm控制GPU调度以及计算读写，计算读写采用本地NVMe固态硬盘，
算完毕后，数据自动拷贝到数据目录。

sobereva · 发表于 Post on 2024-11-12 13:00:46

买两台是最佳选择。单机没有进一步可提升的余地

sss668800 · 发表于 Post on 2024-11-11 20:17:31

CPU：9950x和7950x价格差距1000以内就上9950x

内存可以升级到DDR5 6000的32G*2，价钱和5200几乎一样。

牧生 · 发表于 Post on 2024-11-11 18:50:50

把数量再提高点，买两台

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