[综合交流] 元动力学模拟得到的最小自由能结构和普通动力学模拟不同

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ljh123

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发表于 Post on 2024-12-23 17:12:12 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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使用CP2K+plumed进行元动力学模拟，结果如图。普通动力学模拟平衡时，键长基本在2.1左右。但是以该键长作为CV进行元动力学模拟并绘制自由能面却发现，键长2.3时才有最小的自由能，2.1和2.3之间有一个非常小的能垒，按理来说普通动力学模拟也可以跨越才对。我用stride关键词检查过，该势肼已经收敛了。所以请问下，难道是因为普通动力学模拟得到的，仅仅是势能的极小值点，而势能的极小值点不代表是自由能的极小值点吗？

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