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[Amber] 怎么应用Amber14SB对聚合物优化

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求助一下大家怎么应用Amber14SB力场,对聚合物结构进行分子力学结构优化处理然后再使用Sobtop 1.0程序构建聚合物的力场参数

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发表于 Post on 2025-2-13 09:50:28 | 只看该作者 Only view this author
14SB是蛋白力场 你用来做什么聚合物?

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发表于 Post on 2025-2-10 21:45:23 | 只看该作者 Only view this author
搞清楚力场的基本特征再用
AMBER是蛋白质力场,拿它算聚合物做什么
认真看http://sobereva.com/soft/Sobtop/#FAQ2里关于AMBER和GAFF关系的说明
基于sobtop创建的GAFF力场的拓扑文件,用gromacs做能量极小化即可达到目的
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