各位老师好，求助在进行NVT动力学模拟后GRA的命名变为MOL，请问是什么原因

cgy · 发表于 Post on 2025-2-12 23:56:01

各位老师好，NEMD体系在进行完NVT系综的模拟后，出现了石墨烯命名为GRA变为MOL的情况（图2），因为GRA后面的是MOL组，但模拟之后就GRA组变为MOL组了，且MOL前的数字也变了，请问老师这是什么原因，并且石墨烯组GRA也发生了位置移动，本来mdp文件中设定的是冻结。谢谢老师，附上模拟前后的gro文件和mdp和top文件。

cgy · 发表于 Post on 2025-2-14 10:08:30

pal 发表于 2025-2-13 14:05
GRA变成MOL应该是GRA.itp里面的没改，序号变了正常

麻烦再请教您一个问题，石墨烯我冻结了，但在模拟之后下层的石墨烯跑到了盒子上面是怎么回事，谢谢您。我的这个帖子的问题。http://bbs.keinsci.com/thread-50950-1-1.html

cgy · 发表于 Post on 2025-2-14 09:52:00

pal 发表于 2025-2-13 14:05
GRA变成MOL应该是GRA.itp里面的没改，序号变了正常

还真是，谢谢老师您了，我太粗心了

pal · 发表于 Post on 2025-2-13 14:05:00

GRA变成MOL应该是GRA.itp里面的没改，序号变了正常

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[GROMACS] 各位老师好，求助在进行NVT动力学模拟后GRA的命名变为MOL，请问是什么原因

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