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[CP2K] CP2K分子动力学计算 力场参数单位如何确定?

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大家好:
  量子计算有时候很费时间,在要求不高的情况下,用分子动力学(FIST)模拟也是个不错的选择。
不过力场设置不好,总会出现
             “GEOMETRY wrong or EMAX_SPLINE too small!”
这样错误。本人总是遇到。多方查找,也不知道问题出在哪。
   首先,模型是很简单的(初学测试)Al2O3-(100) slab,固定下面两层,其余弛豫。


其次,力场是公开发表的文献中的 :




采用了GENPOT力场(详情见inp文件)。参数我都进行了仔细的核对,应该问题不大。
如果实在有问题,那就是单位谁设(详情见inp文件)。其他方面,实在想不出会出什么错
(inp文件是Multiwfn生成,几乎没怎么改动)。


所以特请老师、学友们看一看,是不是单位没设的原因?GENPOT力场单位究竟该怎么设?
谢谢大家!!!
MD Geometry inp.inp (4.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)










   

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-22 12:25:21 | 只看该作者 Only view this author
多谢指点!实际上我做个测试,将来扩胞用到大的体系上,然后上面吸附团簇,进而吸附小分子催化。
这样的话,DFT计算就十分吃力了,因此采用QMMM,基底用MM,上面活性部分用QM。
这时候,运行速度会大大加快,可以搜索到更多构型。

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发表于 Post on 2025-2-22 09:06:02 | 只看该作者 Only view this author
这么小的体系,鼓捣分子力场设置的功夫,DFT都跑完了,结果还更精确

CP2K做MM计算要掌握很多知识和逻辑才能正确使用,北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)里面给了详细的介绍和诸多例子,其中和当前问题相关的一页:


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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2025-2-22 01:11:01 | 只看该作者 Only view this author
不是,难道计划研究的体系尺寸大到DFT算不动、研究目标又不需要对电子状态描述准确的结论吗?(而且DFT这种量子化学方法的计算不能简称为“量子计算”,看http://sobereva.com/680)就算DFT算不动也还有GFN-xTB呢。

这种结构在CP2K里恰当设置DFT不可能处理不了,真有什么问题不如直接拿出来(比如因为SCF收敛困难而算得慢,就按http://sobereva.com/665仔细排查),而不是绕弯路折腾什么经典分子力场;即便模拟很快,把找参数、设置输入的准备流程也算上可能根本就省不下多少时间,而且结果能否被认可而发表都十分存疑。单说相互作用势函数及单位的设置就有GENPOT字段的一堆讲究,真心不建议缺乏经验就贸然尝试。
√546=23.36664289109

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