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[ORCA] ORCA计算带过渡金属的结合能的基组推荐

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本帖最后由 阿O 于 2025-2-24 21:17 编辑

请问各位老师,对于过渡金属复合物(150个原子左右,2个过渡金属Zn原子,其余原子是前三周期非金属元素),片段A+片段B共价结合,脱去两分子水生成复合物C,A+B=C+2H20,计算共价结合能。
1、电脑核数8,内存32G。几何优化用PBE0 D3(BJ)/def2-SV(P);单点能计算打算采用PBE0-D3(BJ)/def2.QZVP,请问还有推荐的较大一点的基组吗?

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发表于 Post on 2025-5-27 20:52:14 | 只看该作者 Only view this author
a-Student 发表于 2025-5-27 10:38
老师,打扰您一下,我采用wB97M-V计算结合能,原因是根据博文http://sobereva.com/272。提到wB97M-V基本 ...

例如北京科音中级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KBQC)里幻灯片提到的:

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2025-5-27 14:44:33 | 只看该作者 Only view this author
a-Student 发表于 2025-5-27 10:38
老师,打扰您一下,我采用wB97M-V计算结合能,原因是根据博文http://sobereva.com/272。提到wB97M-V基本 ...

引wB97M-V的原始文献就行了,以及找Head-Gordon之后发的相关综述和benchmark文章
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2025-5-27 10:38:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-2-25 11:35
本来机子就孱弱、体系也大,盲目让别人推荐大基组干嘛,还嫌def2-QZVP不够大?
以你的计算条件,def2-SV(P ...

老师,打扰您一下,我采用wB97M-V计算结合能,原因是根据博文http://sobereva.com/272。提到wB97M-V基本上是所有非双杂化泛函里算基态能量方面问题的平均精度最高的,那么文章中去我应该引哪些文献呢可以证明精度好,麻烦老师推荐下,谢谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-25 12:49:47 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-2-24 21:59
如果能算得动,几何优化最好考虑def-TZVP。如果有Gaussian,还可以考虑Gaussian先优化再喂给Orca。
算能量 ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-25 12:46:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-2-25 11:35
本来机子就孱弱、体系也大,盲目让别人推荐大基组干嘛,还嫌def2-QZVP不够大?
以你的计算条件,def2-SV(P ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2025-2-25 11:35:42 | 只看该作者 Only view this author
本来机子就孱弱、体系也大,盲目让别人推荐大基组干嘛,还嫌def2-QZVP不够大?
以你的计算条件,def2-SV(P)做opt freq能跑得动就很难得了,甭指望用更好的了。本来对这样大小的体系def2-SV(P)优化一般也说得过去(如果牵扯到弱相互作用,建议加上免费校正BSSE问题的gCP)。
单点用def2-TZVPP足矣,更何况是共价结合能又不是弱相互作用因而BSSE问题关键问题,本来普通泛函对基组要求就没那么高。只有普通泛函算弱相互作用能,或者双杂化泛函,一般才有必要用到QZ档次。
能量建议改用PBE0-D4,用wB97M-V更好

参考下文
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva.com/387http://bbs.keinsci.com/thread-6600-1-1.html


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发表于 Post on 2025-2-25 11:32:44 | 只看该作者 Only view this author
别乱找地方发帖,ORCA明显是量子化学程序,发到分子模拟版块做什么。这次给你移动了,以后注意
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发表于 Post on 2025-2-24 21:59:45 | 只看该作者 Only view this author
如果能算得动,几何优化最好考虑def-TZVP。如果有Gaussian,还可以考虑Gaussian先优化再喂给Orca。
算能量极化最好带上。用def2-TZVPP,如果算得动,可以用def2-QZVPP。
另外,如果体系中刚性不够(柔性链很多),可能还要考虑构象搜索。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-24 21:44:11 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-2-24 21:37
几何优化花了多长时间?几何优化这个基组有点不太够看

老师,这个的几何优化正在算,前一个基组(BLYP D3def2-TZVP def2/J)忘记考虑过渡金属了,导致收敛失败,计算了三天

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发表于 Post on 2025-2-24 21:37:20 | 只看该作者 Only view this author
几何优化花了多长时间?几何优化这个基组有点不太够看

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