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[Gaussian/gview] Gaussian 16计算分子单点能无法正常结束如何解决?

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老师们好,我要计算的是多肽小分子,小分子的结构文件是mol2,然后使用Gaussianview保存成com格式,下面是我的com文件的开头


之后通过命令g16 FDVLR.com &提交,计算完成后查看log文件,在文件的最后没有出现NORMAL字样,不知道是什么原因?特此请教,下面是我的log文件的末端截图


FDVLR.com

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FDVLR.log

96.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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发表于 Post on 2025-3-19 08:57:41 | 只看该作者 Only view this author
我看了你1楼附件里的输入文件。电荷和多重度没有问题,这是一个肽,一个氨基和一个胍基带正电,两个羧基带负电,所以电荷和自旋多重度 0 1 没问题。
我觉得主要问题是内存太抠了,这个肽有 94 个原子却只给 4 GB,很离谱,内存建议有多少给多少。
另外还有 2 个问题:
(1)原子坐标后面的 connectivity 建议删掉。
(2)计算时确定不加溶剂(如水)吗?
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2025-3-18 22:35:24 | 只看该作者 Only view this author
你的输入文件可能没贴全。图上部分氢的个数是偶数,但是氮的个数是奇数,这不可能是电中性的。
建议上传gjf或者com文件大家看一下。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-17 20:32:04 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2025-3-17 14:37
(1)体系电荷似乎不太对,看起来不像是电中性的,建议立即检查或找实验室同学/导师讨论。
(2)16核搭配6 ...

内存改写成了62GB,还是不能计算成功。而且电中性确认过了,电荷数确实为0

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发表于 Post on 2025-3-17 15:07:18 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
看“(9)Gaussian任务没有报错,但是却莫名其妙停了怎么办?”部分
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2025-3-17 14:37:03 | 只看该作者 Only view this author
(1)体系电荷似乎不太对,看起来不像是电中性的,建议立即检查或找实验室同学/导师讨论。
(2)16核搭配64GB内存为宜,只给4GB过于抠门。在确保该计算节点内存够用的情况下,应该把内存往大了写。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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