GkS-EDA能量分解结果正常输出，但是能量数值有问题

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-20 14:45:52

本帖最后由 yanglin123 于 2025-3-21 20:33 编辑

使用Gamess进行GKS-EDA进行能量分解时，结果显示的数值大到离谱，检查了inp文件的坐标和基组都没啥问题，还是不知道原因是什么？

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-25 14:49:29

zjxitcc 发表于 2025-3-25 12:14
GAMESS的SCF算法比较差，即使提供收敛的轨道，也有可能优化着跑开了。你可以把$SCF那一行改成这个
$SCF ...

好的谢谢老师，我再试试

zjxitcc · 发表于 Post on 2025-3-25 12:14:33

yanglin123 发表于 2025-3-25 09:04
老师，您好，我用您的方法试了一下另一个体系，但是并没有收敛，这是什么原因呢

GAMESS的SCF算法比较差，即使提供收敛的轨道，也有可能优化着跑开了。你可以把$SCF那一行改成这个
$SCF DIRSCF=.T. DIIS=.F. SOSCF=.T. RESET=.F. $END
这会在MOKIT下一次更新的时候作为默认关键词写进inp文件。

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-25 09:04:02

本帖最后由 yanglin123 于 2025-3-25 14:53 编辑

zjxitcc 发表于 2025-3-20 15:33
正常的啦，本论坛上几乎所有GKS-EDA问题点进去看，底层都是这两个问题：
（1）GAMESS XEDA的输入文件很复 ...

老师，您好，我用您的方法试了一下另一个体系，但是并没有收敛，这是什么原因呢

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-24 09:08:42

zjxitcc 发表于 2025-3-21 21:56
可以到有g09/g16的Linux服务器上安装MOKIT、用frag_guess_wfn。

再次感谢老师，MOKIT程序太好用了，已经成功算出来了，收敛了且数据没有异常

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-22 17:34:07

zjxitcc 发表于 2025-3-21 21:56
可以到有g09/g16的Linux服务器上安装MOKIT、用frag_guess_wfn。

成功算出来了，数据不在异常了，再次感谢老师！MOKIT程序太好用了

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-22 10:54:14

zjxitcc 发表于 2025-3-21 21:56
可以到有g09/g16的Linux服务器上安装MOKIT、用frag_guess_wfn。

谢谢老师，成功得到inp文件啦，接下来可以直接将inp文件提交到集群上吗?

zjxitcc · 发表于 Post on 2025-3-21 21:56:51

yanglin123 发表于 2025-3-21 16:30
用的老师，但是我看了这台笔记本电脑的Linux确实没有高斯。

可以到有g09/g16的Linux服务器上安装MOKIT、用frag_guess_wfn。

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-21 16:30:08

本帖最后由 yanglin123 于 2025-3-21 16:35 编辑

zjxitcc 发表于 2025-3-21 16:23
做计算的课题组的大部分机器都有g09/g16，不用你自己安装。你平时不用g09/g16吗？

用的老师，但是我看了这台笔记本电脑的Linux确实没有高斯。

zjxitcc · 发表于 Post on 2025-3-21 16:23:42

yanglin123 发表于 2025-3-21 16:21
老师，是需要把g09安装到Linux目录下吗

做计算的课题组的大部分机器都有g09/g16，不用你自己安装。你平时不用g09/g16吗？

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-21 16:21:29

zjxitcc 发表于 2025-3-21 15:33
（1）我在2L回复中写着内存180GB、核数48是示例，如果你的机器配置没有这么高，应当将这两个数字改小。
...

老师，是需要把g09安装到Linux目录下吗

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-21 15:36:47

zjxitcc 发表于 2025-3-21 15:33
（1）我在2L回复中写着内存180GB、核数48是示例，如果你的机器配置没有这么高，应当将这两个数字改小。
...

好的老师，谢谢老师！我再试试。

zjxitcc · 发表于 Post on 2025-3-21 15:33:03

yanglin123 发表于 2025-3-21 15:13
知道啦谢谢老师，提交之后当前目录下出现了5个gif文件还有out文件，但是out文件出错了，显示：ERROR in s ...

（1）我在2L回复中写着内存180GB、核数48是示例，如果你的机器配置没有这么高，应当将这两个数字改小。
（2）要确保机器上有g09/g16，比如运行
which g09
which g16
可检查是否有Gaussian可用。frag_guess_wfn需要调用Gaussian做DFT计算。

yanglin123 · 发表于 Post on 2025-3-21 15:13:39

本帖最后由 yanglin123 于 2025-3-22 10:08 编辑

zjxitcc 发表于 2025-3-21 11:51
该按y的时候就按y，不要把下一步应该敲的命令提前贴进去啊，要仔细看屏幕提示啊，英文也要看是什么， ...

知道啦谢谢老师，提交之后当前目录下出现了5个gif文件还有out文件，但是out文件出错了，显示：ERROR in subrouitine submit gau job: Gaussian job failed.
Please open file 001-Be def2svp.log and check. 打开001-Be文件需要检查什么呢？

zjxitcc · 发表于 Post on 2025-3-21 11:51:11

本帖最后由 zjxitcc 于 2025-3-21 12:43 编辑

yanglin123 发表于 2025-3-21 11:38
老师，已经安装成功了，但是好像无法启用frag_guess_wfn小程序，显示找不到，是我少了什么步骤吗

该按y的时候就按y，不要把下一步应该敲的命令提前贴进去啊，要仔细看屏幕提示啊，英文也要看是什么，不能无脑贴下一步的命令啊

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