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[新手求助] DFT计算丙二酸和Zr络合应该是电荷0 自旋多重度1吗?

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这是丙二酸和Zr结合的输入文件,按照6配位考虑Zr,其中两个OH脱H与丙二酸结合,那这时候电荷、自旋多重度应该设置为多少呢?

bingersuan-Zr.gjf

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-24 08:04:02 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2025-3-23 22:11
没啥问题了,电荷和多重度都是对的。
当前结构,跟Zr配位的六个氧偏离八面体结构挺多的,不过还不算离谱 ...

好的好的 谢谢您的指导!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-24 08:03:34 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-3-23 21:29
六配位的话这样设没问题,主要丙二酸要拿掉两个质子

好的好的 谢谢您的指导!

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发表于 Post on 2025-3-23 22:11:32 | 只看该作者 Only view this author
哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-3-23 15:08
老师您好!那我正确绘制了之后是应该设置电荷-2,自旋多重度1吗?

没啥问题了,电荷和多重度都是对的。
当前结构,跟Zr配位的六个氧偏离八面体结构挺多的,不过还不算离谱,应该不会影响优化过程中达到正确的结构。
另外,可能需要确认一下丙二酸的亚甲基氢会不会被拔掉一个。
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2025-3-23 21:29:38 | 只看该作者 Only view this author
哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-3-23 15:08
老师您好!那我正确绘制了之后是应该设置电荷-2,自旋多重度1吗?

六配位的话这样设没问题,主要丙二酸要拿掉两个质子

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-23 15:08:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 哈哈哈哈哈aaa 于 2025-3-23 15:30 编辑
北大-陶豫 发表于 2025-3-23 14:11
你这……丙二酸二负离子的亚甲基氢就杵在 [Zr(OH)4] 的两个氧中间?
摆结构是要符号化学直觉的,不是随便 ...

老师您好!那我正确绘制了之后是应该设置电荷-2,自旋多重度1吗?

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发表于 Post on 2025-3-23 14:11:51 | 只看该作者 Only view this author
你这……丙二酸二负离子的亚甲基氢就杵在 [Zr(OH)4] 的两个氧中间?
摆结构是要符号化学直觉的,不是随便一摆就行的。明显应该让丙二酸二负离子的两个羧基分别连出一根配位键。
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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