Hello all,
我的中文水平有限,所以这篇帖子是用英文写的,并借助了翻译软件。如果表达的意思有些混乱,还请见谅。
我偶然发现了这个论坛,很高兴看到这里有这么多关于计算化学计算机硬件的热烈讨论。在互联网上其他地方很难找到如此具体的话题。根据我在研究中接触各种计算工作流的经验,除了使用机构的高性能计算(HPC)资源或云平台之外,自己组装计算机系统也相当有吸引力。我从十几岁起就开始组装电脑了,所以对计算机硬件方面的事情并不陌生。
最近,受到 sobereva 在本站上推荐硬件的启发,我完成了一套双路 AMD Epyc 9654 的配置。我想要一套在 CPU 密集型工作流方面具有高性价比的系统。这些工作主要包括 DFT 计算,以及用于化学动力学模型的包含数值积分的蒙特卡洛模拟。我还有一套使用了几个月的 AMD Threadripper 7980X + RTX4090 系统。如果大家感兴趣,我很乐意在另一篇帖子中分享那套系统的使用体验,并附上详尽的 ORCA 6 基准测试结果。
系统配置如下: - CPU: 2× AMD Epyc 9654QS (每颗 96 核,2.15 GHz 基础频率 / 3.5 GHz 加速频率)
- 内存 (RAM): 1.15 TB (24 × 48 GB) SK Hynix DDR5 ECC-REG (4800 MT/s)
- 主板: Gigabyte MZ73-LM1 rev 3.2
- 存储: Samsung 990 Pro (4 TB)
- 电源 (PSU): Seasonic Prime TX-1600
- CPU 散热器: Silverstone XE360PDD 一体式水冷
- 机箱: Silverstone RM52
所有部件都是通过不同的淘宝商家订购的。总的来说,组装过程很顺利,所有部件一次点亮,完美运行。以下是一些细节要点:
我听别人说过,'QS' 版(工程样品版)的 CPU 和零售版一样好用,只是如宣传所说,频率略低一些。我的经验确实如此,考虑到价格大幅降低,这非常值得。我怀疑可以通过调整 BIOS 来提高 CPU 频率,但我还没尝试过。
我冒险选择了这款一体式水冷散热器 (XE360PDD),因为它似乎是新产品,我在网上找不到任何评测或更多信息。不过,我的 Threadripper 系统上装的是对应的 Silverstone XE360-TR5 散热器,我对其非常满意。我希望这套系统能有高性能且安静的散热,因为它就放在我旁边的桌子上。在这方面,XE360PDD 散热器的表现远超我的预期。它非常安静,同时在满载情况下能将平均 CCD 温度保持在 68 °C 左右。
这套系统配置了大量内存,主要是为了处理 ORCA 6 中的解析 Hessian 计算,这对于较大的体系会消耗巨量内存。48 GB 的内存条和 32 GB 的价格差不多,并且看起来用着也没问题。装了 24 根内存条,我本来以为至少会有一根出问题,但奇迹般地它们全都正常工作。
对于密集的 ORCA 6 计算,具有较高写入耐久度的快速存储至关重要。用这样的系统,几个月内总写入量很容易超过 1 PB。这也导致 NVMe 硬盘运行温度相当高。我发现需要特别注意 NVMe 硬盘散热片的安装,确保通过导热垫与控制器和存储芯片都良好接触。我不得不在散热片和控制器模块之间额外加了一层导热垫(达到双倍厚度),以确保充分接触。如果不这样做,控制器模块很快就会达到 85 °C 并开始降频(性能节流)。
目前,这套系统正在为我进行的一个项目处理一批计算任务。等这批任务完成后,我将进行详尽的基准测试,并分享结果,以便与 Threadripper 7980X 系统进行直接比较。
Cheers,
David
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