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本帖最后由 iuseroot 于 2025-11-23 23:39 编辑
更新：
2025/11/23：
更新GROMACS版本至2025.4。
2025/10/10：
升级依赖项：OpenBLAS升级为0.3.30并启用LAPACK编译，hwloc升级为2.12.2。
2025/09/03：
更新GROMACS版本至2025.3。
2025/08/03：
1. 应各位网友要求，更新了新的下载链接，有效期1个月。
2. CUDA版本提升至12.8.1，使用50系显卡的网友可以尝试能否正常运行（我没有50系显卡所以无法测试）。
基于GitHub Actions自动化编译，编译器最新版MSVC，保障与Windows的原生兼容性。
运行的操作系统：Windows 10 64-bit 或 Windows 11。
CPU要求：支持AVX2指令的x86_64 CPU （CUDA版也需要满足）。
集成了 FFTW (3.3.10) OpenBLAS (0.3.30) 和 hwloc (2.12.2)。
集成了 CHARMM36 力场（版本：July 2022）。
使用 OpenMP 并行，没有使用 MPI，因此也无需安装任何MPI库。（因为只考虑单台Windows上多线程并行，所以 OpenMP 可以完全可以满足）
没有集成 PLUMED，也没有集成 libtorch （所以 Neural Network potential 是不支持的）
CPU版本同时包含了单精度的 gmx.exe 和 双精度的 gmx_d.exe 。
CUDA版本只包含单精度的 gmx.exe ，要求系统内安装了 CUDA 12.8.1 或更高版本（因此N卡驱动应该是 572.61 或更高的版本）
关于性能：
我只有一个粗略的结果，仅供参考。
CPU版本：因为MSVC的原因，Windows版显著比Linux版慢很多，所以不建议使用Windows上的CPU版。建议此处提供的CPU版仅用于测试（例如短时间运行测试自己做的tpr能不能跑起来）
CUDA版本：在Windows上原生运行的性能和在WSL中运行Linux版性能几乎一致。与原生Linux系统上运行，大约Windows原生版大约只有90%的性能（也就是说跑5天还是跑5天半的区别）。所以Windows原生的CUDA版GROMACS是完全可以接受的，特别是对于机器有限，不方便装Linux的用户而言。
CUDA版下载（需要登录GitHub账号，有效期至2025/12/22）：
（请确定系统内的CUDA版本需要是12.8.1或更高版本）
- https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder/actions/runs/19605702101/artifacts/4652212523
- 文件大小：236 MB
- SHA256: fc93a8f5cfea5260f1490eacda902a1bd43f7f02daddc843862be6a440b1eb50
CPU版下载（需要登录GitHub账号，有效期至2025/12/22）：- https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder/actions/runs/19605702090/artifacts/4652298975
- 文件大小：22 MB
- SHA256: 69b9f402c5eacf012e6c59d8d63dbda661f0d1aac2afe7d9bd19f4bdce0e10d6
GitHub项目链接：
- https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder
Fork后自行编译的朋友请注意GitHub用户协议，请勿滥用GitHub Actions。
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发表于 Post on 2025-5-21 09:19:43
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