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[波函数分析求助] 用Multiwfn绘制的差分电荷密度图中有一半电荷不在原子上?

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老师们,我按照使用Multiwfn作电子密度差图 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元中的步骤绘制的差分电荷密度图里蓝色部分不在原子上,看着像是按照某种方式对称后的。我也重新优化了整体和片段的结构,再次做了单点能计算,结果还是这样,请问应该怎么办?希望各位老师不吝赐教!感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-15 14:06:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-7-15 06:03
认真看博文里nosymm的部分
整体和片段的原子坐标不对应的话,密度差图没有任何意义

好的!谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2025-7-15 06:03:26 | 只看该作者 Only view this author
认真看博文里nosymm的部分
整体和片段的原子坐标不对应的话,密度差图没有任何意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-14 13:16:53 | 只看该作者 Only view this author
睡觉不打鼾 发表于 2025-7-14 10:59
看不出什么原因,盲猜一手没有用nosymm导致原子位置变动

那我试一下,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-14 13:16:29 | 只看该作者 Only view this author
pal 发表于 2025-7-14 11:04
是不是优化了片段结构

不好意思说错了,没有优化片段结构

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发表于 Post on 2025-7-14 11:04:00 | 只看该作者 Only view this author
是不是优化了片段结构

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发表于 Post on 2025-7-14 10:59:48 | 只看该作者 Only view this author
看不出什么原因,盲猜一手没有用nosymm导致原子位置变动

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