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[新手求助] 过渡态优化中,如何让它保留已有虚频继续优化

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楼主
本帖最后由 Dave666 于 2025-8-23 14:51 编辑

在找一个过渡态的过程中,在监测过程中,发现其中一个优化比较接近收敛的点,四个指标如下:
Maximum Force               0.000025     0.000450      YES
RMS     Force                  0.000003      0.000300      YES
Maximum Displacement    0.038291     0.001800      NO
RMS     Displacement       0.009457      0.001200      NO
  
对它进行振动分析,有一个虚频,振动频率数值只有-13(同类反应虚频在-70左右),但符合预期振动方向。
以这个点为起始,继续优化,期望找到它的过渡态,但最后优化得出的结果,虚频振动已经和相关的原子完全无关了,而是配体上的甲基的旋转。

请问老师们,有没有办法保留这个虚频,优化得到相应的过渡态?

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发表于 Post on 2025-8-23 14:59:54 | 只看该作者 Only view this author
冻结反应中心的键长键角等,进行 opt=ModRed freq 计算,看看振动模式是否还正常,正常的话再继续做 opt=(TS,ReadFC,NoFreeze,NoEigen) 试试

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现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-23 14:50:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Dave666 于 2025-8-23 15:02 编辑
wzkchem5 发表于 2025-8-23 14:42
可以先跑个IRC看看。有的反应,过渡态虚频振动方向与预期不符,但IRC能走到正确的反应物和产物,此时以IRC ...

感谢老师的建议。
刚我的问题没叙述完整:最后优化得到的结果,虚频振动方向已经完全和核心反应原子无关了,而是配体上甲基的旋转。
irc跑的话应该是不太可能走到预期反应物和产物了。

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发表于 Post on 2025-8-23 14:42:56 | 只看该作者 Only view this author
可以先跑个IRC看看。有的反应,过渡态虚频振动方向与预期不符,但IRC能走到正确的反应物和产物,此时以IRC结果为准

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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