计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 235|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求助gaussian结合shermo计算pyridine的Gibbs自由能结果与文献存在误差

[复制链接 Copy URL]

19

帖子

0

威望

211

eV
积分
230

Level 3 能力者

各位老师好,我使用与文献相同的计算方法计算pyridine分子的gibbs自由能结果与文献略有误差,参数设置都是完全一致的,因为我算的是pyridine分子,所以并没有设置混合基组SDD,文献中算出的pyridine分子gibbs自由能为-155755.3493kcal/mol,我用shermo算出来的gibbs自由能换算成kcal/mol并且也加上了1.89kcal/mol,结果为-155755.8463kcal/mol,想问问这些误差是怎么导致的,下面我也上传了我的gaussian和shermo输入文件信息以及文献中所用的方法,恳请各位老师指点,文献链接https://doi.org/10.1021/acs.macromol.3c00959

微信图片_20251028094937_13_26.png (238.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

文献方法

文献方法

微信图片_20251028095909_14_26.png (143.82 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

shermo设置

shermo设置

微信图片_20251028101459_15_26.png (124.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

微信图片_20251028101459_15_26.png

pyridine.gjf

784 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

optfreq

pyridine-E.gjf

803 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

单点能

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124706

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2025-10-29 09:21:50 | 只看该作者 Only view this author
谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因
http://sobereva.com/678http://bbs.keinsci.com/thread-38911-1-1.html
谈谈不同量子化学程序计算结果的差异问题
http://sobereva.com/573http://bbs.keinsci.com/thread-20122-1-1.html

仔细把以上文章看了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

19

帖子

0

威望

211

eV
积分
230

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-28 11:02:15 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-10-28 10:47
6-31G(d)基组有个坑是“按genecp的混合基组写法”来用与“直接写在关键词行”来用有不同表现,基函数形式不 ...

谢谢老师的指点

1209

帖子

6

威望

2442

eV
积分
3771

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

2#
发表于 Post on 2025-10-28 10:47:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-10-28 10:50 编辑

6-31G(d)基组有个坑是“按genecp的混合基组写法”来用与“直接写在关键词行”来用有不同表现,基函数形式不同、结果差异明显且不可比较,需对照手册https://gaussian.com/basissets/?tabid=1与讨论帖http://bbs.keinsci.com/thread-19095-1-1.html排查。

编辑:文献除了截图外还应给出doi号等便于检索的信息。泛函选得不合适,看http://sobereva.com/272了解有过渡金属的情况应该怎么用。

√546=23.36664289109

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 21:10 , Processed in 0.714727 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list