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[综合交流] 一个查看 Gaussian Log 文件振动模式的 web 端程序

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Level 5 (御坂)

本帖最后由 wxyhgk 于 2025-11-14 10:08 编辑



在准备本文过程中,我使用了 ChatGPT,Claude ,Notion AI来优化代码,博文结构整理和润色,绘图。
我已对生成的内容进行了必要的审查和编辑,确保了内容的准确性和完整性。





1. 说明

我在公司OLED / MR-TADF 材料的计算化学研究,长期要处理光谱相关任务,尤其是振动精细结构、Franck–Condon 模拟、激发态的构型变化等分析。

这些工作离不开 振动模式的可视化, 不看振动模式,很难判断哪些模式在耦合发射细结构、哪些在影响 ΔE_{ST}

但传统工具的体验实在不理想:

- GaussView:箭头很细,非常难看清楚。
- VMD:虽然功能强,但看个振动却要自己去
    - 写 Tcl 脚本
    - 调箭头长度
    - 设置颜色映射
    - 调阈值
    - 调动画速度

    用来做科研的时间反而花在调参上。

- 其他软件难以跨平台,我平时在 linux,mac,Windows 多个平台协同工作

基于我自己频繁要看 MR-TADF 的振动模式,我写了一个更顺手的工具:

Q-Ctools · ViewFreq — 在线 Gaussian 振动模式查看器, https://q-ctools.vercel.app/ViewFreq/index.html

它完全在浏览器运行,不用安装、不用写脚本、不用调一堆参数,跨平台,全平台可以用,拜托任何平台的束缚,仅需一个浏览器

上传 `.log` / `.out` 后就能直接看振动,所有关键设置(向量、幅度、颜色、速度)都在界面上实时可调,特别适合查看多环、嵌硼、螺芴类 MR-TADF 分子的骨架振动。



2. 基本功能

2.1 振动模式一键预览



- 自动解析 Gaussian 频率区块,列出所有振动模式及其频率。
- 点击某个模式即可播放振动动画,支持快速切换上一/下一模式。

2.2 向量 & 颜色可视化控制

- 显示或者隐藏向量


点击这部分按钮,就能显示或者隐藏向量

- 向量控制


点击向量控制下面的齿轮按钮,即可调整向量的外观,颜色


具体的参数调节什么都在下面的图中


颜色部分,应该不用我说,这个正常人就能看出来

2.2 振动控制


- 振动幅度:控制原子振动的位移范围
- 振动速度:调整动画播放的快慢
- 帧数:设置动画的流畅度,方便后续截图

3. 后期计划

目前这个工具已经能满足日常的振动模式查看需求,但我计划在未来加入以下功能:

- 支持更多量子化学软件的输出格式(如 ORCA、Q-Chem 等)
- 提供振动模式的筛选和搜索功能,快速定位特定频率范围或特定原子参与的振动
- 添加多模式对比功能,可以同时查看和比较不同振动模式的差异






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