分享材料方向的滑稽计算

SharkYYX2025 · 发表于 Post on 2025-11-20 21:57:54

本帖最后由 SharkYYX2025 于 2025-11-26 01:23 编辑

如题，分享一下日常看到的高IF paper的滑稽计算。这种文章并不罕见，审稿人通常是实验对口方向，估计不懂计算。这世界是个巨大的草台班子。
非常幽默的计算，使我大跌眼镜，迷惑行为大赏

后续看到别的会继续连载

1. 奇奇怪怪，张冠李戴
期刊：Advanced Materials IF 26.8
微信公众号在线预览https://mp.weixin.qq.com/s/ysXvpYa4of6jXJedblXcmA
doi.org/10.1002/adma.202514735 通讯作者：上交杨旭东、王涛
题目 Electrostatically Enhanced Self-Assembled Monolayers Anchoring for Scalable and Stable Inverted Perovskite Solar Cells
静电势的色彩轴对不上，不知道从哪里粘贴复制的

，逻辑清奇。把小小的静电势做成了别人看不懂的样子。我寻思不懂计算也能看出来这颜色不对，难不成是色盲？

SI Electrostatically Enhanced Self-Assembled Monolayers Anchoring for Scalable a.pdf (6.52 MB, 下载次数 Times of downloads: 30)

Advanced Materials - 2025 - Wang - Electrostatically Enhanced Self‐Assembled Mo.pdf (2.39 MB, 下载次数 Times of downloads: 7)

2. 指鹿为马，指LU为LO，槽多无口
期刊：Advanced Functional Materials IF 19.0
DOI: 10.1002/adfm.202521431 通讯：苏州大学杨新波&协鑫
微信公众号在线预览https://mp.weixin.qq.com/s/-q4_gWx_uMuOWXN5M2j1Lw
题目Steric-Complementary Synergistic Strategy for High-Efficiency Monolithic Perovskite/Silicon Tandem Solar Cells

Steric-Complementary Synergistic Strategy for High-Efficiency Monolithic Perovsk.pdf (8.22 MB, 下载次数 Times of downloads: 0)

图2ab的图例写的不对。放的ESP和HOMO LUMO，图例写dipole moments and energy levels alignment。然而他没标出偶极矩方向或者数值，让大家猜谜呢。就像huang di的新装，只有聪明人才能看到他的偶极矩。。钙钛矿领域指的“能级排列对齐”研究电荷传输，通常需要比较器件多层结构，这个谁和谁对齐，表意不明。
LUMO写成LOMO。虽然他正文LUMO倒是写对了，但是图里这两个都写错了。没写isovalue等值面大小。ESP没单位，默认a.u.？

图里计算的是限制性闭壳层。相关知识参考：正确地认识分子的能隙(gap)、HOMO和LUMO http://sobereva.com/543 用于非限制性开壳层波函数的双正交化方法的原理与应用 http://sobereva.com/448

支持信息图S9的偶极矩和HOMO LUMO没单位。开个玩笑，他不写，我能不能认为他的偶极矩单位是1000000 D
没找到这个文章计算方法的描述，我不知是我眼花找不到还是真没写。但正文有零散几句描述。一般业内不这么写，都是单独拿出来写在Experimental Section后头

3. 谁偷了石墨烯的色散校正？
期刊：Nature Energy IF 60.1 通讯：大连理工大学王宇迪&史彦涛
https://doi.org/10.1038/s41560-025-01893-8
题目Graphene oxide doping of the hole injection layer enables 23.6% efficiency in perovskite solar cells with carbon electrodes
微信公众号在线预览 https://mp.weixin.qq.com/s/Tk-hE5zKl7mgClcwliwv1w

Graphene oxide doping of the hole injection layer enables 23.6% efficiency in pe.pdf (2.94 MB, 下载次数 Times of downloads: 2)

这个优化时候不加色散校正？而且为何用B3LYP不用ωB97XD？？两个分子都是共轭，石墨烯非常显著大共轭。审稿人是不是不懂计算......
泛函和基组写法不准确
正文图例写LOMO

参考：18碳环（cyclo[18]carbon）与石墨烯的相互作用：基于簇模型的研究一例 http://sobereva.com/615
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的 http://sobereva.com/557

4. 谁偷了基组的极化函数？
期刊：Angew. Chem. Int. Ed. IF 17.0 通讯作者：苏州大学李耀文
doi.org/10.1002/anie.202521774 题目Reversible Thermally Driven Phenyl Torsion in Self-Assembled Monolayers Releases Strain for Heat-Resilient Inverted Perovskite Solar Cells

SI里这个泛函和基组的写法不规范。
没加极化，就是用于分子动力学产生RESP也不能不加极化吧？而且为什么ORCA里头要用Pople基组，不用def2系列？迷惑+1

谈谈量子化学中基组的选择 http://sobereva.com/336

5. 谁偷了膦酸的氢？
期刊：Advanced Functional Materials IF 19.0
DOI: 10.1002/adfm.202501561 题目Enhanced Buried Selective Contacts via Dual-Sided Passivation for Efficient and Stable Perovskite Solar Cells

图1c ESP的正负写反了。O上面的2个氢不见了。实际上三个氧，一个没H，两个有H。我不知道这是怎么建模的，很离谱。不懂计算也不至于这样。这数据完全不能用吧，估计按照中性分子算的

6. 离奇消失的结合能单位
期刊：Nature Photonics IF 32.9 通讯作者：南开大学陈永胜院士&刘永胜
https://doi.org/10.1038/s41566-025-01797-9
题目Spontaneous 2D perovskite formation at the buried interface of perovskite solar cells enhances crystallization uniformity and defect passivation
微信公众号在线预览https://mp.weixin.qq.com/s/dpR5sbXNSeFcwbJ4ecS3IQ

pi-pi相互作用位点是芳环和H，看起来距离有点远，方向有点偏，但这个不算是问题，我只是有疑问。谈谈pi-pi相互作用 http://sobereva.com/737
图3c，结合能，坐标轴没单位。正文讨论写单位了
此文没找到计算方法那一段

hjlyyc0999 · 发表于 Post on 前天 21:10

一般实验的审稿人也不太看计算，就这样过去啦

J.Liu · 发表于 Post on 2026-3-30 22:32:01

这么看来，PBE算弱相互作用不加D3矫正的都算比较强的了

SharkYYX2025 · 发表于 Post on 2026-3-24 23:08:25

cyh时代发表于 2026-3-23 00:04
之前有人找我代算，就要这种等值面图，不明白有什么意义，这种图用VMD或者Chemcraft不好嘛，真的把话说得让 ...

哈哈哈哈，他意图故弄玄虚，实际上成了内行人的乐子

cyh时代 · 发表于 Post on 2026-3-23 00:04:21

之前有人找我代算，就要这种等值面图，不明白有什么意义，这种图用VMD或者Chemcraft不好嘛，真的把话说得让人听不懂，让人听不明白，就以为自己很牛，很神，其实对于懂计算的，如同小丑

wzkchem5 · 发表于 Post on 2026-3-16 09:27:30

Observer-Aya 发表于 2026-3-15 15:12
我们是做熔盐腐蚀的实验组，我本来打算用castep算个一百多个原子体系来研究腐蚀扩散行为的，但合作的指导 ...

这种情况还有一个问题，就是实验上在秒级以上，甚至天级的时间尺度上观察到的腐蚀，计算在ps时间尺度上很可能完全观察不到，甚至腐蚀一个原子都看不到。又不好盲目大幅提高模拟温度来加速腐蚀，那样主要的腐蚀机理可能就变了

Observer-Aya · 发表于 Post on 2026-3-15 15:12:19

SharkYYX2025 发表于 2026-3-14 19:24
好吓人的计算量，拿GFN1-xTB没准能行，DFT做不动吧
高温AIMD不是说一定不行，我个人理解是看物理意义。 ...

我们是做熔盐腐蚀的实验组，我本来打算用castep算个一百多个原子体系来研究腐蚀扩散行为的，但合作的指导老师告诉我至少得上千原子而且cp2k最多效率提三倍根本没法算，算了也不一定有想要的结果，最后就放弃了

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2026-3-14 21:27:47

Observer-Aya 发表于 2026-3-14 14:23
老师请问做上千K温度的AIMD有什么问题吗，我一度打算用CP2K做个一千多个原子的973K的AIMD来着，后来因计 ...

熔盐或者熔融金属之类的体系热浴控温做一两千K温度的AIMD当然还是符合实际的，另外质谱（参见http://bbs.keinsci.com/thread-20479-1-1.html提到的Grimme文章）之类高能量、非热平衡的体系也可以有更高的温度。（但是像http://bbs.keinsci.com/thread-53811-1-1.html最后的表格那样强行把常温量化计算所得反应速率外推到近万K的行为就比较可疑了，这种等离子体似的极端温度下连电子是否还与原子核相互作用、Born-Oppenheimer近似是否成立都不好说的。）

我说的那篇文章是理论计算了假想的“某某原子掺杂的某某纳米体系吸附某某小分子”体系，打算用AIMD说明体系不容易受热自发分解的，此时还跑出一两千K的轨迹且没有展示完整结构截图就非常离谱了。或者也很有可能那几条曲线是别的物理量但图例被误标成了温度……

SharkYYX2025 · 发表于 Post on 2026-3-14 19:24:53

Observer-Aya 发表于 2026-3-14 14:23
老师请问做上千K温度的AIMD有什么问题吗，我一度打算用CP2K做个一千多个原子的973K的AIMD来着，后来因计 ...

好吓人的计算量，拿GFN1-xTB没准能行，DFT做不动吧
高温AIMD不是说一定不行，我个人理解是看物理意义。需要有理由用高温，不能无端设定。这个文章做的东西我也不懂，不好评价。如果他的物理模型不是设定在高温，或者对应实际应用一般是常温，那这个说不通。
比如我在我的研究中，为了研究两个有机小分子的热稳定性，拿ORCA做了高温AIMD，看共价键裂解。这种通常符合物理意义。或者CP2K研究某些有机物高温热解

Observer-Aya · 发表于 Post on 2026-3-14 14:23:38

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-11-28 11:39
逛咱这论坛灌水区的人终归有限，建议像http://bbs.keinsci.com/thread-52582-1-1.html提到的那样，写好英文 ...

老师请问做上千K温度的AIMD有什么问题吗，我一度打算用CP2K做个一千多个原子的973K的AIMD来着，后来因计算量太大放弃了

lindaiyu · 发表于 Post on 2026-3-14 10:29:22

真的难崩啊，发的都还是化学优质期刊呢

不想飞的猫头鹰 · 发表于 Post on 2026-1-2 19:07:11

https://doi.org/10.1002/adma.202301398 作者声称用GROMACS进行了COMPASS力场的计算
https://doi.org/10.1002/adma.202512960 作者声称用VASP进行了B3LYP def2-TZVP的计算

LPOwenChan · 发表于 Post on 2025-12-27 17:06:32

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-12-27 14:16
根据https://doi.org/10.1002/slct.202500161这篇理论计算文章的摘要，一个非整数计量比的混合氧化物钙钛矿 ...

粗略地看了下，承包了我今年的笑点：
1. 把钙钛矿氧化物LaMn0.4Fe0.6O3作为孤立体系来计算，实际计算中是按照Table4中的LaMn3Fe5O12来计算的，不明觉厉；
2. 用了B3LYP和PBE泛函来计算，并且还强调是Restricted方法，计算结果对于过渡金属离子来说估计是毫无意义的；
3. Table5中直接将HOMO-LUMO Gap当作是Band Gap，算出来了-0.012eV这种金属体系才会有的数值，但是引用的实验文献却说是“宽禁带半导体”；
4. Figure2和Table5中的La的Mulliken电荷为+3.6，La会有这种”价态“吗？
5. 计算了这个”分子“的偶极矩与由气相频率导出的热容和熵，这真的有任何意义吗？
6. 煞有介事地给出了这个计算级别下的IR，作者真的知道自己在干什么吗...?
其他一些相当”有意思“的细节：
1. 经典GaussView直出；

2. 似乎也是GaussView直出；

3. 绝对是Excel的柱状图绘图直出，连色彩序列都是默认的。

其他估计还有很多笑点，但是实在不想浪费时间去细看了...
结论1: 写文章的人和审文章的人至少有一方不是人类；
结论2: 原来我不太相信AI能取代一部分人的工作，现在我相信了；
结论3: 仔细看完这篇文章能不笑的人应该可以确诊抑郁症了。
以上。

ChemistrySelect - 2025 - Likhariya - Density Functional Theory DFT Study of La.pdf (3.76 MB, 下载次数 Times of downloads: 19)

AxiEJohn · 发表于 Post on 2025-12-27 15:43:40

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-12-27 14:16
根据https://doi.org/10.1002/slct.202500161这篇理论计算文章的摘要，一个非整数计量比的混合氧化物钙钛矿 ...

ChemistrySelect - 2025 - Likhariya - Density Functional Theory DFT Study of La.pdf (3.76 MB, 下载次数 Times of downloads: 13)

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2025-12-27 14:16:56

根据https://doi.org/10.1002/slct.202500161这篇理论计算文章的摘要，一个非整数计量比的混合氧化物钙钛矿材料竟也能当孤立分子用Gaussian 09计算，期待哪位热心群众上传个全文看看。

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[灌水] 分享材料方向的滑稽计算

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