已经重新安装了几个版本的vmd，要么图形无法加载，要么vmd main窗口不显示

user0203

如题，最开始用的vmd1.9.4版本，但是渲染时无法调用taychon文件，故卸载后重装1.9.3版本。第一次重装用的是原生Windows平台vmd1.9.3 x64版本 - 资源分享 - 计算化学公社这个链接中x64未修改编辑的版本。这个版本我将其安装在C盘非默认目录下，这次安装后解决了taychon文件问题，只是输出结构仍需调整。但是今天突然无法将文件拖入，不知道是哪里有问题，遂又卸载重装。第二次安装vmd官网的1.9.3openGL_CUDA版本，下载后出现了两个问题，第一个是文件无法加载；第二个是VMD main窗口无法显示：在下方列表中显示已打开，但是点不开窗口。这次的安装路径为“D:\study\VMD”。同时试了下在linux下版本的vmd软件，能显示结构，但是vmd main窗口同样无法使用。现在需要大家解决的问题是：1.在windows/linux下如何重新显示vmd main窗口，现在不能显示的原因是什么  2.windows下始终无法加载构型，这个可能是什么原因？3.vmd是否支持透明背景的结构渲染图，具体是什么指令？4. linux下输出透明的高分辨率图片应该如何操作

user0203

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-12-3 17:30
如果确认用的就是1.9.3而不是官网那个半成品1.9.4 alpha（缺文件且有故障），且安装目录只有ASCII字符且不 ...

前两个问题已经解决。第二个是我怎么都打不开了，才往里面拖的。现在通过file-->new molecule发现是不能正确识别中文路径，读出来是一堆乱码，改成英文路径后已经成功打开文件。后两个问题我会先看下相关帖子，有不懂得再来问哒。感谢

Uus/pMeC6H4-/キ

如果确认用的就是1.9.3而不是官网那个半成品1.9.4 alpha（缺文件且有故障），且安装目录只有ASCII字符且不含空格，那么：
1. VMD命令行输入menu main on指令可以打开VMD main窗口，如果仍然无法看到则检查是否被放到当前屏幕外或者被放到分屏之类的地方；
2. 鼠标点击左键把文件拖到VMD命令行只能让文件路径出现在命令行，根本不是正确的打开文件的方法（不知道从哪学的），应当用File - New Molecule窗口打开，或者在命令行用mol new指令加载，或者实在要偷懒也得把文件拖到图形窗口或者VMD main窗口去。
3. 4. 要么tachyon渲染再扣除背景，要么pov-ray渲染并设置透明度，请先仔细搜索论坛过往讨论，有不清楚的再在这里问。