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[CP2K] 求助:cp2k跑AIMD内存一直涨

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楼主
本帖最后由 lyons1 于 2025-12-28 16:19 编辑

===================================================================================
=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
=   PID 148808 RUNNING AT node01
=   EXIT CODE: 9
=   CLEANING UP REMAINING PROCESSES
=   YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES
===================================================================================
YOUR APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Killed (signal 9)
This typically refers to a problem with your application.
Please see the FAQ page for debugging suggestions

起初我用的50核,很快就把我的750G内存沾满了,然后任务被killed,昨天又用16核试,过一个晚上还是会满,感觉他这个AIMD会一直持续占用内存,只print了电荷,没有print cube文件,cp2k版本是2025.02 popt版本的,inp文件已附上,求大佬指点

CP2K.inp

2.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

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发表于 Post on 2025-12-29 11:49:48 | 只看该作者 Only view this author
内存占用量一直涨是内存泄漏问题,是编译、MPI库层面的问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2025-12-29 09:30:53 | 只看该作者 Only view this author
老问题了,至少我测过 2024.1, 2024.2, 2024.3 跑 npt 都会有这种问题,我跑的是 200 原子左右的水溶液,最后只能等耗尽了续跑,反而 nvt 和 nve 没事。

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发表于 Post on 2025-12-28 22:19:04 | 只看该作者 Only view this author
lyons1 发表于 2025-12-28 18:15
好的老师,这个结构是一个溶液盒子而已,有300个原子左右,因为比较普通,就没有上传,感觉应该也不是结构 ...

再普通的结构你上传上来别人才能帮你跑一下看看是啥问题呀

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-28 18:15:18 | 只看该作者 Only view this author
好的老师,这个结构是一个溶液盒子而已,有300个原子左右,因为比较普通,就没有上传,感觉应该也不是结构的问题,因为他scf可以正常收敛,只是说输出了几百步能量后,就报这种错误

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发表于 Post on 2025-12-28 17:48:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 spinel 于 2025-12-28 17:49 编辑

请把结构文件也上传,另外如果是CP2K的初学者,最好用Multiwfn产生输入文件

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