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[Sobtop] sobtop将Se元素识别成ss原子类型的问题

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本帖最后由 知食分子 于 2026-2-14 16:00 编辑

指认原子类型的过程中,选择的是优先指认Gaff原子类型然后再指认UFF力场原子类型,但是sobtop会将Se元素识别成GAFF力场的ss原子类型,而不是UFF力场的UF_Se原子类型。请问这种情况如何把Se的原子类型手动改过来?
13S : ss         Sp3 S in thio-ester and thio-ether
   14C : c2         Sp2 C
   15C : c2         Sp2 C
   16C : c2         Sp2 C
   17C : c2         Sp2 C
   18Se: ss         Sp3 S in thio-ester and thio-ether


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 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 18:54 | 只看该作者 Only view this author
KazusaT 发表于 2026-2-14 16:21
6 Manually set atom type for selected atoms

非常感谢,我试试!

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发表于 Post on 前天 16:21 | 只看该作者 Only view this author
6 Manually set atom type for selected atoms

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