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[波函数分析求助] 求助:基于键临界点的电子密度估计内氢键键能

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各位老师好,我用AIM拓扑分析基于键临界点的电子密度估计内氢键键能,图片如下,发现化合物A的苯环的碳原子和化合物B的苯环的碳原子之间连接的也有键径,是否说明两个苯环的碳原子之间也存在氢键相互作用。请各位老师批评指正。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 7 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-3-5 09:04
你当前关心的是氢键,你不管其它BCP和拓扑路径不就完了
pi-pi作用区域为什么不能出现键径?什么时候键径 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 9 hour ago | 只看该作者 Only view this author
yangna11 发表于 2026-3-5 08:56
谢谢老师。这个图是通过Multiwfn结合VMD自动绘制的AIM拓扑分析图,因此我要手动把这几个不是氢键的键径删 ...

你当前关心的是氢键,你不管其它BCP和拓扑路径不就完了
pi-pi作用区域为什么不能出现键径?什么时候键径必须对应氢键了?
强烈建议系统学习AIM拓扑分析知识:
量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班(http://www.keinsci.com/WFN
AIM学习资料和重要文献合集 http://bbs.keinsci.com/thread-362-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 10 hour ago | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2026-3-4 14:53
推荐了解一下键临界点(BCP)是什么,这不是一个氢键的专属概念,C-C氢键是个很幽默的说法
可以说这里存在相 ...

好的,谢谢老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 10 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-3-5 08:32
做分析时要结合最基本常识,都不涉及氢怎么可能是氢键
认真把此文看了
谈谈pi-pi相互作用

谢谢老师。这个图是通过Multiwfn结合VMD自动绘制的AIM拓扑分析图,因此我要手动把这几个不是氢键的键径删除吗。这个地方应该是pi-pi相互作用,但是不知道为什么这个地方会有键径

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发表于 Post on 10 hour ago | 只看该作者 Only view this author
做分析时要结合最基本常识,都不涉及氢怎么可能是氢键
认真把此文看了
谈谈pi-pi相互作用
http://sobereva.com/737http://bbs.keinsci.com/thread-51636-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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鸩羽

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发表于 Post on yesterday 14:53 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wal 于 2026-3-4 14:57 编辑

推荐了解一下键临界点(BCP)是什么,这不是一个氢键的专属概念,C-C氢键是个很幽默的说法
可以说这里存在相互作用,看着像pi-pi stacking,做个NCI/IGMH应该可以看到绿片片
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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