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[波函数分析交流] AIM学习资料和重要文献合集

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发表于 2014-11-29 22:48:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
为方便大家学习AIM理论知识,在此将有价值的AIM学习资料,包括重要AIM文献、综述整理到一起,下载地址:http://pan.baidu.com/s/1pJqgOsz
Multiwfn是最好的做AIM分析的程序,下载地址见http://sobereva.com/multiwfn的置顶。


初学者建议优先其中看打星号的:

*The Quantum Theory of Atoms in Molecules-From Solid State to DNA and Drug Design(Matta,Boyd):这本书的第一章最适合初学者最初学习AIM的基本概念。后面的章节介绍了AIM理论在各个领域的拓展,给出了很多实例,可以有选择性地阅读。

*Some concepts in wavefunction analysis:是Multiwfn 2013年培训班中的幻灯片,后来又经过一些修订。AIM里的最重要的概念在里面都有涉及,从114页开始专门讲AIM拓扑分析和盆分析。

*Atoms in Molecules(from Encyclopedia of Computational Chemistry)、A quantum theory of molecular structure and its applications这两篇都是比较完整的AIM综述,推荐阅读。

Chemical Bonding and Molecular Geometry-From Lewis to Electron Densities:6、7两章和AIM直接相关,其它章节可以略过。

Atoms in Molecules-A Quantum Theory:这是Bader的代表作,是AIM的圣经。内容相对较深,不适合初学者,而适合专门希望深入研究的人阅读。

Atoms and Molecules.chm:这是来自Bader个人主页上的AIM介绍的页面组成的文档。

Are There Atoms in Molecules-ATOMS AND THE MOLECULAR STRUCTURE HYPOTHESIS:随便看看就行了。

Meaningful Structural Descriptors from Charge Density:这篇是个比较初级的AIM综述,没什么深入的内容,只对初学者有用。

Atoms in Molecules(Ruud Visser)、Bader Analysis-Calculating the Charge on Individual Atoms in Molecules & Crystals:这两个幻灯片都很一般,随便看看就行了。

=================

压缩包里“与AIM相关的有意义的文献和一些方法的原文”这个文件夹里是一些AIM领域方面的原文,以及一些笔者认为比较重要、有普遍意义的文献。文件名开头注明了文章主要内容。包含以下文件:

│  AIM定域化分析原文-Spatial localization of the electronic pair and number distributions in molecules.pdf
│  AIM最初文献-Virial Field Relationship for Molecular Charge Distributions and the Spatial Partitioning of Molecular Properties.pdf
│  AIM键级与椭率-Description of Conjugation and Hyperconjugation in Terms of Electron Distributions.pdf
│  AOM键级-Covalent bond orders in the topological theory of atoms in molecules.pdf
│  BCP判断成键类型-Experimental Electron Density Analysis of Mn2(CO)10-Metal-Metal and Metal-Ligand Bond Characterization.pdf
│  BCP处能量密度判断键类型-Chemical Bonds without Bonding Electron Density — Does the Difference Electron-Density Analysis Suffice for a Description of the Chemical Bond.pdf
│  eta指数判断成键类型-Experimental Charge Density Study of a Silylone.pdf
│  Li、Na晶体中有赝原子-Topological analysis of the charge density of solids-bcc sodium and lithium.pdf
│  NBCP-Natural Bond Critical Point Analysis-Quantitative Relationships Between Natural Bond Orbital-Based.pdf
│  Virial path-Structural homeomorphism between the electron density and the virial field.pdf
│  wfx格式原文-Subshell Fitting of Relativistic Atomic Core Electron Densities for Use in QTAIM Analyses of ECP-Based Wave Functions.pdf
│  划分晶体类型-A Classification of Covalent, Ionic, and Metallic Solids Based on the Electron Density.pdf
│  划分晶体类型-Bond metallicity of materials from real space charge density distributions.pdf
│  多中心DI-Multicenter bonding within the AIM theory.pdf
│  拉普拉斯键级-Bond Order Analysis Based on the Laplacian of Electron Density in Fuzzy Overlap Space.pdf
│  源函数原文-A Green's function for the density.pdf
│  源函数大综述-The Source Function Descriptor as a Tool to Extract Chemical Information from Theoretical and Experimental Electron Densities.pdf
│  用0.001密度等值面定义范德华表面-Properties of atoms in molecules atomic volumes.pdf
│  离域化指数-The Lewis Model and Beyond.pdf
│  离域化指数、模糊键级、Mayer键级的对比-Comparison of the AIM Delocalization Index and the Mayer and Fuzzy Atom Bond Orders.pdf
│  第一次实验且第一次在有机化合物中发现赝原子-First Experimental Characterization of a Non-nuclear Attractor in a Dimeric Magnesium(I) Compound.pdf
│  赝势对AIM的影响-Topological analysis of electron density distribution taken from a pseudopotential calculation.pdf
│  
├─IQA原子间能量成分分析
│      IQA分析卤键-On the Physical Nature of Halogen Bonds-A QTAIM Study.pdf
│      IQA原文-A Molecular Energy Decomposition Scheme for Atoms in Molecules.pdf
│      IQA原文-Interacting Quantum Atoms A Correlated Energy Decomposition Scheme Based on the Quantum Theory of Atoms in Molecules.pdf
│      IQA积分算法-Two-electron integrations in the quantum theory of atoms in molecules.pdf
│      
└─弱相互作用相关
        AIM、ELF联合分析氢键-Intramolecular Hydrogen Bonds-the QTAIM and ELF Characteristics.pdf
        AIM研究二氢键-Comparative Study of Weak Interactions in Molecular Crystals-H-H Bonds vs Hydrogen Bonds.pdf
        AIM研究二氢键-Properties of the C-H---H Dihydrogen Bond-An ab Initio and Topological Analysis.pdf
        BCP动能密度,势能密度,曲率的关系-Experimental electron density overlapping in hydrogen bonds-topology vs. energetics.pdf
        Charge Density Methods in Hydrogen Bond Studies.pdf
        eta指数原文-Halogen Bonding-A Study based on the Electronic Charge Density.pdf
        Lipkowski氢键AIM简化标准-Properties of the C-H---H Dihydrogen Bond An ab Initio and Topological Analysis.pdf
        Popelier判断氢键存在的AIM标准-Characterization of C-H-0 Hydrogen Bonds on the Basis of the Charge Density.pdf
        Rozas氢键强度分类-Behavior of Ylides Containing N, O, and C Atoms as Hydrogen Bond Acceptors.pdf
        二氢键综述-Dihydrogen Bonds-Novel Feature of Hydrogen Bond Interactions(extracted from Practical Aspects of Computational Chemistry).pdf
        拉普拉斯拓扑分析讨论卤键-Nature of halogen bonding.pdf
        氢键键能、距离、G(r)、势能密度、键长的关系-Hydrogen bond strengths revealed by topological analyses of experimentally observed electron densities .pdf
        能量密度除rho(Bond degree)-From weak to strong interactions.pdf

2015-Feb-13增补: Atoms in molecules as non-overlapping, bounded, space-filling open quantum systems.pdf (816.97 KB, 下载次数: 238)

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发表于 2014-12-1 14:07:37 | 显示全部楼层
:D,再次感谢!
与其念念不忘,不如相忘于江湖。

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发表于 2014-12-1 15:32:23 | 显示全部楼层
感谢分享,辛苦了。

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发表于 2015-7-6 14:02:09 | 显示全部楼层
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发表于 2015-9-13 17:39:35 | 显示全部楼层
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发表于 2015-9-17 16:33:09 | 显示全部楼层
谢谢sob老师分享!

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发表于 2016-2-12 16:23:26 | 显示全部楼层
O(∩_∩)O谢谢,好东西,正好需要,楼主辛苦了

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发表于 2016-2-15 21:32:57 来自手机 | 显示全部楼层
感谢sob老师,最近一段正在找AIM相关资料,辛苦了。

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发表于 2017-5-22 20:42:20 | 显示全部楼层
谢谢老师

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发表于 2018-9-6 02:45:27 | 显示全部楼层
再这么看下去,我都要改行了。

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发表于 2018-9-6 03:52:17 | 显示全部楼层
请问老师:周期性体系的AIM计算该怎么做?有现成的程序可以用吗?谢谢

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 楼主| 发表于 2018-9-6 04:04:33 | 显示全部楼层
pyscf 发表于 2018-9-6 03:52
请问老师:周期性体系的AIM计算该怎么做?有现成的程序可以用吗?谢谢

有一些程序,诸如critic2之类,反正都不好用
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发表于 2018-9-11 23:40:02 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-9-6 04:04
有一些程序,诸如critic2之类,反正都不好用

明白 谢谢老师
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