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[GROMACS] GROMACS中考虑溶剂模型拟合RESP电荷问题

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楼主
各位老师好,我通过GROMACS进行分子动力学模拟的体系为盐湖中金属离子从水相到有机相的萃取,其中有机相为两种溶剂的混合,初始盒子分别建立了1.有机相和水相的混合模型,以及2.水相和有机相的界面模型(金属离子在有机相),想分别考察金属离子在混合有机相是否能够实现对金属离子水合作用的破坏,以及金属离子进入有机相后的稳定性。我想知道在这两种体系中我该如何考虑溶剂模型进行RESP电荷拟合?一、我看RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元例子中举出了乙醇环境中甲醇的RESP拟合,但对于我的溶质应该是金属离子,也就是带固定的整数电荷且结构单一,也要按照例子中对金属离子进行隐式溶剂拟合下的RESP吗,如果需要的话是怎么拟合呢,因为我有有机相和水相两种?2.如果同时要考察有机相混合溶剂的相互作用,那么是否也需要对两种混合溶剂设定溶质和溶剂,并对量少的溶质进行溶剂环境的RESP电荷拟合?

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发表于 Post on 2026-3-23 23:39:43 | 只看该作者 Only view this author
单一金属离子不需要,直接按形式电荷来设置就行(部分力场可能对电荷缩放),如果是像MoO42-这种就需要计算不同原子上的电荷了

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