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[波函数分析求助] 静电势图红白蓝颜色是否必须表示正负值,能否示意相对强弱

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本帖最后由 elsafrozenx 于 2026-4-26 22:50 编辑

帖主正在计算带强正电荷的质子化氨基硅醇,由于整个分子电势为正,若使用刻度正负对称的方式绘制ESP(上图),分子呈现单一的红色,无法反映出静电势的强弱。能否使用刻度非对称的方式绘图(下图),使红蓝色代表静电势的相对强弱,同时标注极值进行分析?

202604262206551469..png (134.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 4 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-4-27 09:15
按照下文绘制时,自己把色彩刻度范围调成非对称完全可以。当静电势负值和正值部分都有时,如果你想让别人能 ...

好嘞,谢谢sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 4 hour ago | 只看该作者 Only view this author
-HMDS- 发表于 2026-4-26 22:59
我之前画过类似的图,个人认为在给定cbar的情况下是可以的,对于带电分子很多情况下整个ESP面都是正值或者 ...

嗯嗯,感谢感谢

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发表于 Post on 7 hour ago | 只看该作者 Only view this author
按照下文绘制时,自己把色彩刻度范围调成非对称完全可以。当静电势负值和正值部分都有时,如果你想让别人能够根据蓝色、红色能直接看出来哪些地方是静电势为负和为正的区域,可以在VMD里的Graphics - Colors - Color Scale里调色彩刻度的Midpoint,使得零点精确对应正白色位置。
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on yesterday 22:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 -HMDS- 于 2026-4-26 16:01 编辑

我之前画过类似的图,个人认为在给定cbar的情况下是可以的,对于带电分子很多情况下整个ESP面都是正值或者负值。不过对于你的这个体系我的个人建议可以考虑用一下红蓝直接过渡的颜色,而不是红白蓝,如果你觉得直接把白色设为非0容易误导人的话。

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