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[综合交流] 怎样才算是稳定的分子:我的一些理解(Update2)

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本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-1-12 14:56 编辑

说实话,这个帖子我以前在木虫上发过,当时是回复梦的眼睛的帖子
后来我又在百度空间发过,增加了一些东西,算是update1吧。
现在又想到一些东西,增添些内容,改进一下,放在这儿吧,算update2。
看看俺能不能在科音论坛早日混到level3好自定义头衔呀:P

当时梦的眼睛问的问题如下
从进入研究生以来,无数次的听见老师或者同学说检验物质的稳定性就需要查看一下体系的homo和lumo的能级差!却也没人说原因。

我自己寻思寻思,大概找到以下原因:
gap小 两种可能
第一种 gap小的物质 如果它的HOMO能级正常的话 那么LUMO能级就特别低 那么LUMO就特容易接受电子 也就特别容易被还原 所以不稳定
第二种 gap小的物质 如果它的LUMO能级正常的话 那么HOMO能级就特别高 那么HOMO就特容易失去电子 也就特别容易被氧化 所以不稳定
结论 gap小确实不稳定

至于gap大就稳定这种说法,谁这么说的话,我就只能送四个字,纯属扯淡

确认一个分子是不是stable如果这么简单咱们QCer们是不是都该去死?
如果HOMO-LUMO的gap太低,那么这个分子当然不稳定。但是,究竟低到什么程度才不稳定呢?我也不知道!大家看这篇文章(JACS, 133, 30)的分子不是照样稳定下来了嘛,而且还长出了分子晶体,还在常温下测出了紫外-可见-近红外谱!它的Gap多小啊?看这篇文章吧(JPCA, 115, 13811),才0.51eV。所以我也不知道Gap究竟多小才能稳定下来啦~
如果S0-S1的gap太低,那么这个分子当然不稳定(这一条并非重复上一条内容。事实上按照TDDFT的计算,S0-S1的gap有较大可能性小于HOMO-LUMO的gap,较小可能性大于。这可能与我长期跟pi体系打交道有关)
如果这个分子是事实上的mix状态,那么这个分子当然不稳定
如果算出来某个原子或者某个区域的Fukui指数太大,那么这个分子当然不稳定(反应活性太强)
如果电子弥散程度太大,那么这个分子当然不稳定
如果两个分子碎片之间的连接太弱,那么这个这个分子当然不稳定
如果分子过于扭曲或者内部空阻太大导致分子内斥力太强,那么这个这个分子当然不稳定
如果随便接受一个光子它就会跃迁到某势能面,而这个势能面恰好和其他势能面有圆锥交叉,那么这个分子当然不稳定。
如果这个分子处于局域最小点而不是全局最小点,同时在共同所处的势能面上的局域最小点和全局最小点之间的过渡态能垒又不大,那么这个分子当然不稳定
我试着把分子放在强电场中,分子开始扭曲变形。此时分子的稳定性与HOMO-LUMO的gap就毫无关系了,而是与连接键的强度有关。类似问题也出现在模拟机械拉压测试中
我在做非线性光学材料的模拟的时候,我发现,如果所加的激光波长恰好等于分子本身的固有振动频率,那么很明显,该分子会出现极大地共振现象,甚至有可能造成分子本身的破碎。这个稳定性也跟所谓的HOMO-LUMO的gap无关。
也是在做非线性光学材料的模拟的时候,我发现有个文章(JACS, 128, 1072)论述了在一个四吡咯环内半嵌了一颗或几颗碱金属原子。说实话,这个文章论述的事儿是十分新颖的,但是如果说这个分子能稳定下来,就是让蒋介石打死戴笠,我也不信,因为碱金属周边那么疏松弥散的电子云,怎么可能安分下来?
在做分子光开关的时候,我也发现一件事儿(JPCA, 116, 6785),钴酞菁分子和富勒烯分子之间组成了超分子体系。但是,这个体系极其敏感,加一颗电子,就能让Co原子和C=C双键之间的配位键的Mayer键级从3.08级降到0.32级,键长从2.02埃增加到2.78埃(这有实验验证哦)。这个不稳定跟HOMO-LUMO的gap也没有任何关系,而是……嗯……比较复杂,主要是强大的引力和强大的斥力之间形成了危险的平衡游戏,一个小的改动就能把这个平衡打破,进而形成新的平衡。具体去看论文吧。


暂时想到这么多 大家补充

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发表于 Post on 2022-4-2 16:22:47 | 只看该作者 Only view this author
anlancx 发表于 2022-4-2 07:46
谢谢老师,关于这个,我又想到一点,我理解的化学稳定性是和反应活性相关的,对于有机电致发光材料,大部 ...

嗯,光稳定性也是需要考虑的。但是不存在化学反应绝对是错的,这种共轭材料的自由基即便无水无氧,也会夺取周边分子的氢、和周边分子加成,乃至自身发生电环化反应等等。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2022-4-2 14:46:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-4-2 00:12
这个帖子已经说了,用HOMO-LUMO gap衡量稳定性是极其不可靠的。
最可靠的做法还是列举所有可能的分解途 ...

谢谢老师,关于这个,我又想到一点,我理解的化学稳定性是和反应活性相关的,对于有机电致发光材料,大部分最后都是隔水隔氧的,应该不存在化学反应,所以这里将电稳定性转化为自由基的化学稳定性考虑是不是不太合适?我有一种看法,将这里的电稳定性转化成自由基的光稳定性来考察,是不是更合适一点?请老师指点,谢谢。

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发表于 Post on 2022-4-2 00:12:29 | 只看该作者 Only view this author
anlancx 发表于 2022-4-1 07:57
感谢老师的回答!
在这种特定情况下,将电稳定性转化成自由基的化学稳定性来考虑,这里我有一个衍生出来 ...

这个帖子已经说了,用HOMO-LUMO gap衡量稳定性是极其不可靠的。
最可靠的做法还是列举所有可能的分解途径,分别算自由能垒,哪怕用便宜一些的方法(比如半经验方法),也比基于DFT的HOMO-LUMO gap靠谱
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-4-1 14:57:52 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-31 16:26
这个问题比较复杂。电压对于分子的影响分两种,一种是电场导致的极化作用,一种是电解,也就是外加电压导 ...

感谢老师的回答!
在这种特定情况下,将电稳定性转化成自由基的化学稳定性来考虑,这里我有一个衍生出来的问题,自由基的化学稳定性如何衡量呢,是否可以参照中性分子那样,分析自由基的前线轨道能级,或者拿得电子/失电子后的HOMO减去中性分子的HOMO,得到变化值,进而判断自由基的稳定性呢?

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发表于 Post on 2022-3-31 16:26:19 | 只看该作者 Only view this author
anlancx 发表于 2022-3-30 17:11
重温老帖,又有了新的疑惑。
这里看各位大佬对稳定性进行细分,主要分为光稳定性、热稳定性、机械稳定性、 ...

这个问题比较复杂。电压对于分子的影响分两种,一种是电场导致的极化作用,一种是电解,也就是外加电压导致分子得到电子或者失去电子。对于有机电致发光材料,电场的影响可以忽略不计,所以导致不稳定性的应该主要是得失电子以后发生的不可逆过程。所以我觉得这种特定情况下的电稳定性应该可以按自由基阴离子、自由基阳离子的化学稳定性来考虑。如果是几十、几百kV的器件的绝缘层的稳定性问题,可能还需要考虑电场的影响,也就是电场存在下的化学稳定性。
不过我也不太确定,看看其他人的见解如何
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-3-31 00:11:26 | 只看该作者 Only view this author
重温老帖,又有了新的疑惑。
这里看各位大佬对稳定性进行细分,主要分为光稳定性、热稳定性、机械稳定性、化学稳定性。
对于我的工作中还设计到一种稳定性:电稳定性。在有机电致发光材料中,在恒定电压下,随着时间变化,材料衰减会越来越严重,这与热、光、化学、机械稳定性关系应该不大。
但是 1.该如何对电稳定性进行定义呢?我的想法是:分子加电压后,得失电子后保持原有性能的能力。
2.如何对电稳定性定量研究呢?


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发表于 Post on 2019-6-12 21:56:10 | 只看该作者 Only view this author
superrice 发表于 2015-1-14 01:23
这篇文章可能会有点帮助。

谢谢分享!

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发表于 Post on 2019-5-9 08:44:16 | 只看该作者 Only view this author
15661161162 发表于 2019-5-8 21:41
老师如果是比较俩个有机小分子看那个稳定需要计算什么呢

仔细看前面的讨论
已经说得很充分了,稳定是个极度含糊的词
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-5-8 22:19:14 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
至于gap,你看金属和石墨gap为零,不也超稳定存在吗?

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发表于 Post on 2019-5-8 22:16:34 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
化学如中医。很多都是经验性的,说没用吧,有时还管用。再如,一般说自由基不稳定,可空气中绝大多数O2就是三线态的,说它不稳定你拿什么来呼吸?可要说它稳定吧,你的呼吸,金属表面的自然氧化,汽车发动等等靠的就是它的活性啊。所以,所谓稳定与不稳定都是相对的。有点类似那句话来着,毒与不毒在于其使用的量,我们也可以说,稳定不稳定在于其存在的量。

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发表于 Post on 2019-5-8 21:41:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-1-10 19:11
总有人问怎么判断稳不稳定,但有个关键性的前提总是被提问者忽略:稳不稳定是对什么而言的?
对光稳定、对 ...

老师如果是比较俩个有机小分子看那个稳定需要计算什么呢

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发表于 Post on 2019-4-20 21:10:45 | 只看该作者 Only view this author
请问您在文中提到的给分子加强电场,是通过实验加的吗,以及加的电场有多大,是否会发生分子得/失电子变成阴/阳离子的情况

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发表于 Post on 2018-3-28 10:03:08 | 只看该作者 Only view this author
好帖,尤其是HUMO-LUMO gap这个讨论提供的一些例子太赞了。一千句理论比不上一个例子啊。不过话说回来,HUMO-LUMO gap也不能一棍子打死,之所以很多人拿它说事儿也不是完全不通,只不过它不能构成一个完整的分子稳定性判断依据。电子跃迁或者剥夺可能导致分子结构或者局部结构失稳时可能的。不过这只是失稳的第一步,即电子激发,分子成为活性分子。活性分子有两种命运,一种是退一步失活,一种是进一步反应。其实最外层电子每时每刻都在不停的跳上去跳下来,绝大多数情况,他们都老老实实回来了,而只有极个别情况下它们失足导致了分子结构失稳。因此,分子失稳至少是个2步过程:激活和失足。而整个失稳的概率必然是两步概率的乘积。有的分子第二步的概率小,那它的稳定性就取决于第一步电子激活步即gap跃迁步;有的分子第二步的概率大,那第一步gap跃迁就对稳定性的贡献小。以上就是从反应动力学角度去分析HOMO-LUMO gap在分子稳定性判断上的贡献,所述分子稳定性是指由于最外层电子跃迁导致的分子激活的情况,此跃迁一般由光子吸收或者热碰撞导致的电荷转移导致。

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发表于 Post on 2018-3-27 15:02:31 | 只看该作者 Only view this author
  每次看到这些发帖都会学到很多,有时候很多问题根本没有去进行过多的思考,在以后的学习中一定要克服这个毛病,谢谢大神们的分享。

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发表于 Post on 2018-3-27 09:47:36 | 只看该作者 Only view this author
希望这个帖子不要沉下去,这里的讨论很有价值
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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