分子中原子间成键的判断

xujian · 发表于 Post on 2017-6-26 20:29:51

计算的分子如图一所示（B3LYP/Def2-TZVPP），想知道S2和O5、N4和O5之间的键连，用NBO分析Wiberg键级（如图二），结果为S2和O5应该不成键，N4和O5之间为单键，后用Multiwfn计算MBO和LBO，分别为图三和图四，根据MBO的结果,似乎应该跟WBI结果类似,但是LBO的结果却说明了S2和O5、N4和O5之间都不存在化学键，考察其RDG等值面（如图一），它们之间又不存在弱相互作用，这些结果放在一起有点confused，请问应该怎么综合这些分析？谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2017-6-27 17:58:03

xujian 发表于 2017-6-27 08:44
谢谢老师，还想请问一下，您是怎么判断出当前情况用LBO是不合适的？

当前是电负性很大的原子间成键，有一定电荷转移键特征，这种类型的键在相互作用区域之间电子不会明显聚集，而且S的半径又比较大，所以电子密度拉普拉斯函数在相互作用区域里体现不出什么来。

xujian · 发表于 Post on 2017-6-27 08:44:26

sobereva 发表于 2017-6-26 23:28
当前就别用LBO了，因为这有点电荷转移键特征，电子在原子间凝聚程度低。
Mayer和NAO基下的Wiberg键级结论 ...

谢谢老师，还想请问一下，您是怎么判断出当前情况用LBO是不合适的？

sobereva · 发表于 Post on 2017-6-26 23:28:54

当前就别用LBO了，因为这有点电荷转移键特征，电子在原子间凝聚程度低。
Mayer和NAO基下的Wiberg键级结论是一致的，已经能说明S2-N4、N4-O5作用比较强，而S2-O5作用弱一些。

图1我没看到，当前情况属于化学键作用，电子密度显著大于RDGmaxrho默认设定的0.05，因此肯定看不到RDG等值面。要作图考察应当用ELF或LOL或变形密度，对S2-N4-O5的平面作图

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[波函数分析求助] 分子中原子间成键的判断