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[波函数分析求助] 分子中原子间成键的判断

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发表于 2017-6-26 20:29:51 | 显示全部楼层 |阅读模式
计算的分子如图一所示(B3LYP/Def2-TZVPP),想知道S2和O5、N4和O5之间的键连,用NBO分析Wiberg键级(如图二),结果为S2和O5应该不成键,N4和O5之间为单键,后用Multiwfn计算MBO和LBO,分别为图三和图四,根据MBO的结果,似乎应该跟WBI结果类似,但是LBO的结果却说明了S2和O5、N4和O5之间都不存在化学键,考察其RDG等值面(如图一),它们之间又不存在弱相互作用,这些结果放在一起有点confused,请问应该怎么综合这些分析?谢谢!

1498479178(1).png WBI.png MBO.png LBO.png

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发表于 2017-6-26 23:28:54 | 显示全部楼层
当前就别用LBO了,因为这有点电荷转移键特征,电子在原子间凝聚程度低。
Mayer和NAO基下的Wiberg键级结论是一致的,已经能说明S2-N4、N4-O5作用比较强,而S2-O5作用弱一些。

图1我没看到,当前情况属于化学键作用,电子密度显著大于RDGmaxrho默认设定的0.05,因此肯定看不到RDG等值面。要作图考察应当用ELF或LOL或变形密度,对S2-N4-O5的平面作图
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 楼主| 发表于 2017-6-27 08:44:26 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2017-6-26 23:28
当前就别用LBO了,因为这有点电荷转移键特征,电子在原子间凝聚程度低。
Mayer和NAO基下的Wiberg键级结论 ...

谢谢老师,还想请问一下,您是怎么判断出当前情况用LBO是不合适的?

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发表于 2017-6-27 17:58:03 | 显示全部楼层
xujian 发表于 2017-6-27 08:44
谢谢老师,还想请问一下,您是怎么判断出当前情况用LBO是不合适的?


当前是电负性很大的原子间成键,有一定电荷转移键特征,这种类型的键在相互作用区域之间电子不会明显聚集,而且S的半径又比较大,所以电子密度拉普拉斯函数在相互作用区域里体现不出什么来。
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