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[Gaussian/gview] 高斯计算错误,说内存不足?

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我的输出文件
%chk=test.chk
%mem=2000MB
%nprocs=4
#p b3lyp/6-31g* opt=(maxstep=4) td=(singlets,nstates=60,root=1,direct) scf(maxcyc=500) nosymm
test
0 1
N                  2.09488500    1.95869800    0.61929600
C                  2.01034900    1.90742200    2.03123900
C                  2.90491200    0.90680000    2.50080100
C                  1.23319600    2.64794100    2.92233200
C                  3.01120200    0.63343300    3.86367000
后面还有很多坐标。
这事我对s1的优化,之前出错误,一直调,都调了2月了,sob指点了很多。才把命令行改为上面那样。但是这次出现的错误时:
Leave Link  716 at Tue Jan 20 09:00:23 2015, MaxMem=  262144000 cpu:      81.8
(Enter /home/software/g09/l103.exe)
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Erroneous write. Write 824 instead of 2448.
fd = 4
orig len = 2448 left = 2448
g_write


看过帖子,说是内存不足,我把这个%mem=2000MB调大?我感觉这个很大了,再就是,我们的服务器用的人很多,天天爆满。
谢谢指点
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发表于 Post on 2023-7-6 11:20:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-6 09:25
搞清楚当前实际空余物理内存有多少

好的,麻烦老师了

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发表于 Post on 2023-7-6 11:19:36 | 只看该作者 Only view this author
好的,麻烦老师了

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发表于 Post on 2023-7-6 09:25:17 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2023-7-5 18:42
sob老师你好,之前按这个方法将之前设置的-M- 115G 调整为80G,问题就解决了,但是服务器算了几个简单的 ...

搞清楚当前实际空余物理内存有多少
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发表于 Post on 2023-7-5 18:42:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-26 21:51
仔细看下文,正确配置Default.Route里的-M-,别过大
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sob ...

sob老师你好,之前按这个方法将之前设置的-M- 115G 调整为80G,问题就解决了,但是服务器算了几个简单的任务又出现了这个问题,不知为何

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发表于 Post on 2023-6-30 09:16:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-29 23:34
电源坏了,主板坏了等等

谢谢老师

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发表于 Post on 2023-6-29 23:34:33 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2023-6-29 10:45
sob老师,那台机器现在就是计算一段时间会卡死,就是黑屏点击没有任何反应,远程链接就会断掉显示Connect ...

电源坏了,主板坏了等等
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发表于 Post on 2023-6-29 10:45:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-27 23:18
后台跑的程序不同,导致剩余内存量不同

sob老师,那台机器现在就是计算一段时间会卡死,就是黑屏点击没有任何反应,远程链接就会断掉显示Connection closed by foreign host.
是跟内存有关吗,该怎么解决呢

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发表于 Post on 2023-6-29 09:38:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-27 23:18
后台跑的程序不同,导致剩余内存量不同

谢谢老师!

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发表于 Post on 2023-6-27 23:18:26 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2023-6-27 09:14
谢谢sob老师,我改了内存现在可以计算,但是奇怪的是之前这个机器的计算是正常的,设置的内存和另一台也 ...

后台跑的程序不同,导致剩余内存量不同
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发表于 Post on 2023-6-27 09:14:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-26 21:51
仔细看下文,正确配置Default.Route里的-M-,别过大
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sob ...

谢谢sob老师,我改了内存现在可以计算,但是奇怪的是之前这个机器的计算是正常的,设置的内存和另一台也是一模一样,放置了一段时间重新插电计算就出现了这个问题。

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发表于 Post on 2023-6-26 21:51:42 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2023-6-26 15:00
sob老师你好!我跟帖问一下我出现的一个内存问题,这是计算很小的分子,提交之后就显示无法分配内存了。
...

仔细看下文,正确配置Default.Route里的-M-,别过大
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发表于 Post on 2023-6-26 15:00:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-1-20 18:41
是opt=(maxstep=10,notrust),否则maxstep只对第一步生效。
就算人多,2000M也太小了,后HF级别的任务很 ...

sob老师你好!我跟帖问一下我出现的一个内存问题,这是计算很小的分子,提交之后就显示无法分配内存了。
Gaussian 16:  ES64L-G16RevA.03 25-Dec-2016
                26-Jun-2023
******************************************
%chk=C3.chk
---------------------------
# opt freq b3lyp/6-31g(d,p)
---------------------------
1/18=20,19=15,26=3,38=1/1,3;
2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=101,11=2,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/18=20,19=15,26=3/3(2);
2/9=110/2;
99//99;
2/9=110/2;
3/5=1,6=6,7=101,11=2,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3;
4/5=5,16=3,69=1/1;
5/5=2,38=5/2;
7//1,2,3,16;
1/18=20,19=15,26=3/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
galloc:  could not allocate memory.

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发表于 Post on 2023-6-26 13:26:24 | 只看该作者 Only view this author
(1)“M0620X”写错了;(2)最好使用#p而非#,输出内容更多,便于监控计算进度;(3)用
%mem=10GB
%nprocshared=8
这种格式指定计算所用的内存和核数。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2023-6-26 08:50:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zhangzhiyuanscu 于 2023-6-26 08:51 编辑
sobereva 发表于 2015-1-20 08:38
优化第一激发态,没必要nstates=60,这会严重浪费时间
nosymm是多余的
maxstep=4没意义,要设定步长上限 ...

sob老师,您好!
我在使用高斯的时候遇到了l502.exe错误。大概查了一下似乎是由于内存的原因。
我在g16运算的时候没有设置内存容量,请问这种情况下给一个更大的内存是否能够避免这个问题呢?如果设置一般设置多少合适呢?我计算的体系是(100个重原子之内的有机配体+一个主族金属元素)

报错的gjf文件以及error文件如下:
------------------------------------------------------------------------------
%CPU=0-63
# M0620X/Def2SVP SCRF pop(Always)

CC(Oc1ccc(cc1)[N]1([Sr])c2ccccc2C(=O)C1=O)C

2 1
C           1.00336        -0.45979         0.29980
C           2.52088        -0.36095         0.09629
O           2.97741         0.85190        -0.41102
C           2.65725         1.56691        -1.52395
C           3.70401         2.19963        -2.20800
C           3.45409         3.00830        -3.32165
C           2.14072         3.20745        -3.77953
C           1.08985         2.57121        -3.08637
C           1.34268         1.76344        -1.97934
N           1.85987         4.12699        -4.84799
C           0.62561         3.97738        -5.54998
C           0.23945         2.87268        -6.31509
C          -1.03488         2.88203        -6.90960
C          -1.90135         3.98079        -6.72873
C          -1.49413         5.08976        -5.96927
C          -0.22281         5.06234        -5.40354
C           0.48471         6.05019        -4.62453
O           0.08540         7.15506        -4.28740
C           1.79728         5.47207        -4.36961
O           2.71104         6.03236        -3.78840
C           3.21500        -0.56795         1.44433
H           0.47724        -0.53600        -0.66881
H           0.62347         0.39206         0.90331
H           0.75505        -1.40759         0.82347
H           2.83524        -1.18115        -0.58483
H           4.72277         2.07802        -1.86125
H           4.28986         3.50210        -3.79420
H           0.05878         2.72475        -3.37617
H           0.48629         1.36002        -1.48044
H           0.90384         2.02802        -6.44423
H          -1.35606         2.03821        -7.50626
H          -2.88285         3.97370        -7.18413
H          -2.14645         5.94264        -5.83355
H           2.91958         0.23478         2.15562
H           4.31744        -0.53601         1.31437
H           2.94145        -1.55219         1.88063
Sr          4.02585         3.72827        -6.33312


---------------------------------------------------------------------------------------
Error: hangup
Error: hangup
   rax fffffffffffffffc, rbx 0000000000000001, rcx 000014c96cbbd337
   rdx 0000000000000000, rsp 00007ffc833b4268, rbp 00007ffc833b42d0
   rsi 00007ffc833b4288, rdi 0000000000007ef1, r8  000014c96cec6600
   r9  0000000000000000, r10 0000000000000000, r11 0000000000000246
   r12 00007ffc833b4288, r13 0000000000000066, r14 0000000000000000
   r15 00007ffc833baca0
   rax 000000000000002b, rbx 000014c335b4be10, rcx 000000005d5f8d80
   rdx 000014c335b4b460, rsp 00007ffece8cb798, rbp 000014c335b4c000
   rsi 000014c335b4b650, rdi 000000000000003e, r8  000000005d5f8280
   r9  000014c335b4b840, r10 000014c335b4ba30, r11 000014c335b4bc20
   r12 000014c335b4c1f0, r13 0000000000000f80, r14 0000000000000058
   r15 00000000000000a8
  /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0(+0x12980) [0x14c368054980]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x129948b]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x1164490]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x1164143]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x11593fc]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x66089e]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0xaebe05]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0xfa8e30]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0xfa6a92]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0xc4764f]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0xad90c0]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x644a61]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x4c83d6]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x6dd2a5]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x50a78d]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x55d278]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x467b15]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x45a227]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x450c2b]
  /home/zzy/sw/g16/l502.exe() [0x450b34]
  /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(__libc_start_main+0xe7) [0x14c3678d4c87]
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