计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 21445|回复 Reply: 24
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] guess=mix 对能量造成差异的原因

[复制链接 Copy URL]

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
在对一个体系计算之前,推测为双自由基体系,于是用guess=mix关键词,但根据输出文件中mulliken spin density判断,没有双自由基的特征,此时就用普通计算单重态的方法计算,但两种方法得到的能量有明显的差异,请问这是什么原因

51

帖子

0

威望

141

eV
积分
192

Level 3 能力者

25#
发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-8-13 20:01
正确

HF有严重的高估对称破缺的倾向。只要DFT下R的波函数是稳定的,一般就可以用RCCSD(T)

好的,感谢sob老师

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120180

管理员

公社社长

24#
发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2025-8-13 18:46
sob老师您好,我计算这种体系时第一步还是直接用opt freq,优化过后对得到的结构进行stable=opt,如果稳 ...

正确

HF有严重的高估对称破缺的倾向。只要DFT下R的波函数是稳定的,一般就可以用RCCSD(T)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

51

帖子

0

威望

141

eV
积分
192

Level 3 能力者

23#
发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-12 16:20
你就用“用stable=opt先得到稳定的波函数再读取波函数优化结构”,在此结构下,再guess=read并且做一下 ...

sob老师您好,我计算这种体系时第一步还是直接用opt freq,优化过后对得到的结构进行stable=opt,如果稳定就用这个结构,若不稳定就读取稳定的波函数再优化,对优化后的结构再检测波函数稳定性,这样反复直到最终结构稳定,请问sob老师我这种操作流程是正确的吗?

最近算了一个自旋多重度为1的有机体系,几何优化时我就是这么做的,用的WB97XD,优化后的结构在RWB97XD下是稳定的,但是后续我用CCSD(T)算单点时,先检测了HF波函数的稳定性,发现是在UHF下波函数更稳定,和几何优化的情况不同,一个是R稳定,一个是U稳定,请教sob老师这是正常的吗?先谢谢sob老师。

4114

帖子

4

威望

8873

eV
积分
13067

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

22#
发表于 Post on 2020-6-14 17:00:29 | 只看该作者 Only view this author
XZDZ 发表于 2020-6-14 16:46
老师,不好意思,我还是没弄明白这个问题。单重态理想值是0.0,三重态理想值是2.0?那双重态的呢?这个是 ...

量化课基本知识,理想值为S(S+1)。因此二重态<S**2>理想值就是0.75
自动做多参考态计算的程序MOKIT

154

帖子

0

威望

1173

eV
积分
1327

Level 4 (黑子)

21#
发表于 Post on 2020-6-14 16:46:04 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2019-3-28 16:24
单重态理想值当然是0了,都叫“单重态”了。

老师,不好意思,我还是没弄明白这个问题。<S**2>单重态理想值是0.0,<S**2>三重态理想值是2.0?那双重态的呢?这个是怎么来计算的呢?

4114

帖子

4

威望

8873

eV
积分
13067

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

20#
发表于 Post on 2019-3-28 16:24:26 | 只看该作者 Only view this author
XZDZ 发表于 2019-3-28 15:58
不好意思老师,请问的单重态理想值是多少啊?

<S**2>单重态理想值当然是0了,都叫“单重态”了。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

154

帖子

0

威望

1173

eV
积分
1327

Level 4 (黑子)

19#
发表于 Post on 2019-3-28 15:58:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-9 12:51
必定有一个没收敛到稳定波函数,stable一测试就知道谁不稳定
另外,原子的Mulliken自旋布居不为0不意味着 ...

不好意思老师,请问<S**2>的单重态理想值是多少啊?

17

帖子

0

威望

389

eV
积分
406

Level 3 能力者

18#
发表于 Post on 2017-10-6 17:26:05 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢社长

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120180

管理员

公社社长

17#
发表于 Post on 2017-10-6 11:57:34 | 只看该作者 Only view this author
qingqing1223 发表于 2017-10-5 21:17
社长请问我在低级别理论水平用#opt freq m062x/def2-svp guess=mix nosymm 优化双自由基体系,检测了一下优 ...

既然读取的就已经是对称破缺态了,还写mix只会捣乱
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

17

帖子

0

威望

389

eV
积分
406

Level 3 能力者

16#
发表于 Post on 2017-10-5 21:17:55 | 只看该作者 Only view this author
社长请问我在低级别理论水平用#opt freq m062x/def2-svp guess=mix nosymm 优化双自由基体系,检测了一下优化的最终结构波函数稳定性,以及确定是对称破缺态,然后提高理论水平,读取低级别的结构及波函数,分别用# opt freq m062x/def2-tzvp guess=(mix,read) nosymm geom=allcheck 和# opt freq m062x/def2-tzvp guess=read geom=allcheck 再次优化结构,最终得到的结构键长相差0.064,且第二种方法计算出的能量比第一种计算出来的低600多Kcal/mol,请问社长我这样做合理吗? 以及提高理论级别之后为什么加不加guess=mix nosymm  最终结果差这么多?谢谢

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-14 09:48:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-12 12:59
当没经验、拿不准时就stable测一下。
此时用热力学组合方法可能够呛,未必那个合适的初猜能传递给每一 ...

老师,关于热力学组合方法适合可以用“guess=read”关键词,我问了高斯客服,他是这么答复我的:"The short answer is yes. the Guess=Read option will only apply to the initial optimization step of the compound method and each of the latter steps will read the result from the prior step as a starting point.  That said you should check the results of the intermediate to make sure your state is being maintained. That said, all of these methods use B3LYP for the original optimization.  You should check to see if this instability also occurs with B3LYP/CBSB7 for CBS-QB3 or B3LYP/GTBas3 for G4." 我的问题是:为何他让我在 B3LYP/CBSB7 for CBS-QB3 or B3LYP/GTBas3 for G4在这些水平下检测稳定性,而不是B3LYP/6-311G(2d,d,p) for CBS-QB3 or B3LYP/6-31G(2df,p) for G4.

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120180

管理员

公社社长

14#
发表于 Post on 2017-9-12 16:20:43 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-9-12 15:32
谢谢老师,那是不是代表“有稳定波函数存在的对称破缺方法优化出来的结构”以及“用stable=opt先得到稳定 ...


你就用“用stable=opt先得到稳定的波函数再读取波函数优化结构”,在此结构下,再guess=read并且做一下stable,如果还显示是稳定的,那这个就是稳定结构100%没问题。

前者说法太含糊。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-12 15:32:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-12 15:15
如果当前结构和“用stable=opt先得到稳定的波函数再读取波函数优化结构”的结构不同,那结果必然不同

...

谢谢老师,那是不是代表“有稳定波函数存在的对称破缺方法优化出来的结构”以及“用stable=opt先得到稳定的波函数再读取波函数优化结构”都属于这个分子的稳定结构?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120180

管理员

公社社长

12#
发表于 Post on 2017-9-12 15:15:31 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-9-12 14:59
谢谢老师,我用stable检测对称破缺方法的波函数,出现“The wavefunction is stable under the perturbat ...

如果当前结构和“用stable=opt先得到稳定的波函数再读取波函数优化结构”的结构不同,那结果必然不同

对于同一个几何结构,只可能有一个解用stable测出来是“The wavefunction is stable under the perturbations considered”的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 05:18 , Processed in 0.168175 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list